โรงเรียนบ้านศรีนคร ก่อตั้งเมื่อปี พ.ศ. 2510 โดยทำพิธีเปิดเมื่อวันที่ 20 กุมภาพันธ์ 2511 โดยเป็นการรวมตัวของกลุ่มชาวบ้านศรีนคร หมู่ที่ 6 ตำบลคีรีเขต ได้ยื่นเสนอต่อผู้ปกครองนิคมสร้างตนเองธารโต เพื่อขอสร้างโรงเรียนเนื่องจากเป็นชุมชนที่อยู่ห่างไกลจากตัวอำเภอเข้าไปในป่าลึกและห่างจากสำนักงานการประถมศึกษาอำเภอธารโต ประมาณ 10 กิโลเมตร เส้นทางคมนาคมยากลำบาก เป็นเส้นทางทุรกันดารต้องสัญจรไปมาตามไหล่เขา โดยเฉพาะฤดูฝนเส้นทางจะถูกดินจากไหล่เขาถล่มลงมาทับเส้นทางเป็นระยะเวลานาน ทำให้ไม่สามารถสัญจรไปมาได้สะดวก จากเหตุผลดังกล่าวทำให้มีการจัดตั้งโรงเรียนบ้านศรีนครขึ้น
สำหรับในด้านการประกอบอาชีพ ประชากรส่วนใหญ่มีอาชีพทำสวน ทั้งสวนยางพาราและสวนผลไม้ โดยเฉพาะทุเรียนและลองกองจะมีการปลูกกันมาก
เดิมโรงเรียนบ้านศรีนคร มีชื่อว่า “ โรงเรียนนิคมสร้างตนเองธารโต 3 ” โดยมีผู้มาดำรงตำแหน่งครูใหญ่คนแรกคือ นายกลั่น คงยืน ในปี พ.ศ. 2512 ทำการสอน ประถมศึกษาปีที่ 1 – ประถมศึกษาปีที่ 4 ซึ่งในขณะนั้นมีจำนวนนักเรียนเพียง 44 คน
ปี พ.ศ.2519 องค์การบริหารส่วนจังหวัดยะลา ได้อนุมัติเงินงบประมาณ 180,000 บาท สร้างอาคารเรียน แบบ ป.1ก ขนาด 4 ห้องเรียน
ปี พ.ศ.2520 ได้เปิดทำการสอนระดับประถมศึกษาตอนปลาย มีนักเรียน ชั้น ประถมศึกษาปีที่ 5 จำนวน 15 คน
ปี พ.ศ.2521 องค์การบริหารส่วนจังหวัดยะลา ได้อนุมัติเงินงบประมาณ 160,000 บาท สร้างอาคารเรียน แบบ ป.1ก ขนาด 2 ห้องเรียน
ปี พ.ศ.2524 องค์การบริหารส่วนจังหวัดยะลา ได้อนุมัติเงินงบประมาณ 115,000 บาท สร้างอาคารประกอบ ( โรงอาหารหรือโรงฝึกงาน )
ปี พ.ศ.2530 ได้เปลี่ยนชื่อ โรงเรียนนิคมสร้างตนเองธารโต 3 มาเป็น “ โรงเรียนบ้านศรีนคร ”
ปี พ.ศ.2534 ได้รับประมาณจาก สปช. จำนวน 860,000 บาท สร้างอาคารเรียนแบบ สปช.102/26 ขนาด 3 ห้องเรียน และในปีเดียวกันได้เปิดทำการสอนในระดับมัธยมศึกษาตอนต้นตามโครงการขยายโอกาสทางการศึกษา
ปี พ.ศ.2537 สปช. ได้อนุมัติงบประมาณ จำนวน 1,639,000 บาท สร้างอาคารเรียน แบบ สปช.105/29 ขนาด 4 ห้องเรียน ยกพื้นใต้อาคารโล่ง
ปี พ.ศ.2543 โรงเรียนได้ยุบระดับมัธยมศึกษาตอนต้นตามมติที่ประชุมคณะกรรมการโรงเรียนและผู้ปกครอง เนื่องด้วยเหตุผลจากกการขาดอัตรากำลังครู ทำให้การเรียนการสอนในระดับมัธยมศึกษาไม่ค่อยได้ผลเท่าที่ควร
ปี พ.ศ.2550 โรงเรียนได้เป็นโรงเรียนต้นแบบวิถีพุทธ
ปัจจุบันโรงเรียนบ้านศรีนคร เปิดทำการสอนตั้งแต่ ระดับอนุบาล – ชั้นประถมศึกษาปีที่ 6 จำนวน 8 ห้องเรียน มีนักเรียนทั้งสิ้น 105 คน ข้าราชการครู 7 คน , พนักงานราชการ 3 คน ,นักการภารโรง 2 คน พนักงานธุรการโรงเรียน 1 คน