โรงเรียนบ้านบูเกตยามู ตั้งอยู่ที่หมู่บ้านบูเกตยามู หมู่ที่ 7 ตำบลควนโดน อำเภอควนโดน จังหวัดสตูล ก่อตั้งเมื่อปี พ.ศ.2509 โดยอาศัยที่ดินของมัสยิดปลูกสร้างอาคารเรียนชั่วคราว จำนวน 1 หลัง มีนักเรียนประถมศึกษาปีที่ 1 เพียงชั้นเดียว และในปี พ.ศ.2510 ได้สร้างอาคารแบบ ป.1 ช เป็นอาคารกึ่งถาวร ขนาด 2 ห้องเรียน งบประมาณ 35,000 บาท (ปัจจุบันได้รื้อถอนไปแล้ว) สร้างในที่ดินของราษฎรบริจาค จำนวน 3 ไร่ 3 งาน 22 ตารางวา ในปี พ.ศ.2519 ทางโรงเรียนได้รับงบประมาณ 280,000 บาท สร้างอาคารเรียนแบบ ป.1 ขนาด 4 ห้องเรียน จนถึงปี พ.ศ.2533 ทางโรงเรียนได้รับงบประมาณ 300,000 บาท ต่อเติมอาคารเรียนจำนวน 2 ห้องเรียนและในปีนี้ โรงเรียนได้เปิดขยายชั้นเรียนถึงชั้นประถมศึกษาปีที่ 5 และชั้นประถมศึกษาปีที่ 6
ในปี พ.ศ.2525 ด้รับบริจาคที่ดินจาก นายเน๊าะ ปะดุกา จำนวน 2 ไร่ 2 งาน 56 ตารางวาและได้รับจัดสรรงบประมาณสร้างอาคารเอนกประสงค์ แบบ สปช.202/26 จำนวน 1 หลัง
ในปี พ.ศ.2539 ได้รับจัดสรรงบประมาณก่อสร้างอาคารเรียนแบบ สปช.102/26 จำนวน 4 ห้องเรียน งบประมาร 866,000 บาท
ปัจจุบันโรงเรียนบ้านบูเกตยามู มีอาคารเรียนทั้งหมด 2 หลัง 10 ห้องเรียน อาคารเอนกประสงค์ 1 หลัง และห้องส้วมที่ใช้การได้ 2 หลัง มีไฟฟ้าใช้ทุกห้องเรียน และทุกห้องเรียนมีพัดลมเพดานใช้ทุกห้องเรียน เปิดทำการสอนตั้งแต่ชั้นอนุบาล ถึงชั้นประถมศึกษาปีที่ 6 มีห้องปฏิบัติการทางภาษา จำนวน 1 ห้อง และ มีข้าราชการครูจำนวน 9 คน พนักงานราชการ จำนวน 1 คน ผู้ทำหน้าที่แทนนักการฯ จำนวน 1 คน
ที่ตั้งของโรงเรียนอยู่ห่างจากที่ว่าการอำเภอควนโดน ประมาณ 7 กิโลเมตร ห่างจากโรงพยาบาลควนโดน 8 กิโลเมตร ห่างจากสำนักงานเขตพื้นที่การศึกษาสตูล 27 กิโลเมตร เส้นทางไปโรงเรียนเป็นถนนลาดยาง