โรงเรียนบ้านปันจอร์  ตั้งอยู่หมู่ที่ 7  บ้านปากบาง  ตำบลย่านซื่อ  อำเภอควนโดน  จังหวัดสตูล  อยู่ในเขตองค์การบริหารส่วนตำบลย่านซื่อ ทำการสอนครั้งแรกเมื่อวันที่  20  เมษายน  2522  โดยมีนายเดช  หมาดทิ้ง เป็นผู้บริหารคนแรก

     ปี พ.ศ. 2521 ชาวบ้านปันจอร์ นำโดยนายเดช  หลีเส็น ผู้ใหญ่บ้านในขณะนั้นได้ร่วมกันบริจาคเงินเพื่อจัดซื้อดิน ได้รับงบประมาณสนับสนุนการก่อสร้างอาคารเรียน แบบ ป.1 ก จำนวน 4 ห้องเรียน จาก นพค.54 สตูล  และมหาวิทยาลัยศรีนครินทรวิโรฒ มหาสารคาม เป็นเงิน 350,000 บาท

     ปี พ.ศ. 2522 เปิดรับนักเรียนชั้น ป.1-2 ทำการสอนตามหลักสูตรประถมศึกษา พ.ศ. 2521

     ปี พ.ศ. 2524 ได้รับงบประมาณก่อสร้างอาคารเรียนแบบ 017 1 หลัง จำนวน 4 ห้องเรียนเงิน 1,143,200 บาท ต่อมาต่อเติมอีก 4 ห้องเรียน และก่อสร้างส้วม แบบ 410 จำนวน 4 ที่นั่ง เป็นเงิน 28,000 บาท

     ปี พ.ศ. 2526   ได้รับงบประมาณก่อสร้างอาคารเอนกประสงค์ แบบ 203-2026 ขนาด 10X20 เมตร จำนวน 1 หลังเป็นเงิน 350,000 บาท

     ปี พ.ศ. 2528  ได้รับงบประมาณพัฒนาจังหวัด สร้างอาคารละหมาด ขนาด  8X12  เมตร จำนวน 1 หลัง เงิน 50,000 บาท

     ปี พ.ศ. 2539 ได้รับงบประมาณก่อสร้างอาคารเรียนแบบ 105/29 จำนวน1 หลัง 6 ห้องเรียน เป็นเงิน1,780,000บาท

     ปี พ.ศ. 2545 ได้รับงบประมาณจาก อบจ.สตูล ปรับปรุงพื้นห้องละหมาด เป็นเงิน 70,000 บาท

     ปี พ.ศ. 2548 คณะกรรมการโรงเรียนและผู้ปกครอง ได้จัดเลี้ยงน้ำชาเพื่อหาเงินก่อสร้างรั้วโรงเรียน

     ปี พ.ศ. 2549 ได้รับงบประมาณปรับปรุงระบบไฟฟ้าภายในเป็นเงิน 372,000 บาทและได้รับงบประมาณจัดซื้อเครื่องคอมพิวเตอร์ จำนวน 17 เครื่องเป็นเงิน 422,999 บาท

     ปี พ.ศ2552  คณะครูร่วมกันบริจาคเงินจำนวน 25000 บาทเพื่อซื้อดินถมปรับปรุงสนามฟุตบอลโดยองค์การบริหารส่วนจังหวัดสตูล ให้การสนับสนุนเครื่องจักรกล

     ปี พ.ศ. 2552 โรงเรียนได้จัดซื้อที่ดินจากนายกาหรีม  หลังเกต เป็นเงิน 38,000 บาท

     ปัจจุบันเปิดทำการสอนตั้งแต่ชั้นอนุบาลปีที่ 2 ถึงชั้นประถมศึกษาปีที่ 6 มีนักเรียน ทั้งสิ้น 300 คน