โรงเรียนบ้านอุได สร้างและเปิดทำการสอนครั้งแรกเมื่อวันที่ 13 สิงหาคม พ.ศ. 2502 โดยได้รับความร่วมมือจากกำนันตำบลแป-ระ และนายสลำ อ้นวิเศษ ผู้ใหญ่บ้านหมู่ที่ 10 นายดอละ สิงหล ผู้ใหญ่บ้านหมู่ที่ 11 ได้บริจาคที่ดินมีเนื้อที่ 13 ไร่ 2 งาน 36 ตารางวา มีอาณาเขตดังนี้
ทิศเหนือ ยาวประมาณ 110 วา จดที่ดิน นายรวย ชุมชาติ
ทิศใต้ ยาวประมาณ 110 วา จดถนนหมู่บ้าน
ทิศตะวันออก ยาวประมาณ 46 วา จดที่ดิน นายช่วง เลหนูกลิ่น
ทิศตะวันตก ยาวประมาณ 46 วา จดที่ดิน นางเพ็ญ ยืนยง
โดยได้ลงหลักปักเขตแน่นอน เมื่อวันที่ 26 กันยายน 2509 โดยผู้ช่วยศึกษาธิการจังหวัด กำนัน ผู้ใหญ่บ้าน คณะครู และผู้ปกครองนักเรียน
ในปีแรกที่เปิดสอบมีครูเพียงคนเดียวคือ นายนคร จิตผิวงาม เป็นครูใหญ่มี 1 ห้องเรียน นักเรียน 35 คน อาคารเรียนชั่วคราวเป็นเสาไม้กลม ฝาไม้ไผ่ หลังคามุงจาก
ปีการศึกษา 2507 ได้รับงบประมาณสร้างบ้านพักครู 1 หลัง เป็นเงิน 13,000 บาท
ปีการศึกษา 2512 ได้รับงบประมาณสร้างอาคารเรียนแบบ ป.1ก. ขนาด 2 ห้องเรียน 1 หลังเป็นเงิน 72,000 บาท
ปีการศึกษา 2518 ได้รับงบประมาณสร้างอาคารเรียนแบบ ป.1ก. ขนาด 2 ห้องเรียน 1 หลังเป็นเงิน 150,000 บาท
ปีการศึกษา 2521 ได้รับงบประมาณต่อเติมอาคารเรียนแบบ ป.1ก. ขนาด 2 ห้องเรียน เป็นเงิน 300,000 บาท บ้านพักครู 2 หลัง 1 ห้องนอนเป็นเงิน 341,000 บาท และงบประมาณก่อสร้างส้วมแบบกรมสามัญ จำนวน 2 ที่นั่ง 1 หลัง
ปีการศึกษา 2521 หน่วยพัฒนาการเคลื่อนที่จังหวัดสตูลได้สร้างถังเก็บน้ำฝนขนาด 10 x 10 x 2.10 เมตร เป็นเงิน 140,000 บาท
ปีการศึกษา 2525 ได้รับงบประมาณก่อสร้างส้วมแบบ สปช. 1 หลัง 5 ที่นั่งพร้อมที่ถ่ายปัสสาวะ เป็นเงิน 45,000 บาท
ปีการศึกษา 2531 ได้รับรางวัลโรงเรียนดีเด่นอันดับ 1 ระดับจังหวัดได้รับเกียรติบัตรที่คุรุสภาในวันประถมศึกษาแห่งชาติเมื่อวันที่ 25 พฤศจิกายน 2531
ปีการศึกษา 2532 ได้รับรางวัลโรงเรียนพระราชทาน ระดับประถมศึกษาขนาดกลาง
ปีการศึกษา 2532 ได้รับรางวัลสถานศึกษาดีเด่น ระดับจังหวัด ในด้านการเสริมสร้างวินัยนักเรียน
ปีการศึกษา 2533 ได้รับรางวัลโรงเรียนจัดกิจกรรมการเรียนการสอนประชาธิปไตยดีเด่น วันประถมศึกษาแห่งชาติ
ปีการศึกษา 2535 ได้รับงบประมาณก่อสร้างอาคารเรียนแบบ สปช. 102/22 จำนวน 4 ห้องเรียนเป็นเงิน 760,000 บาท บ่อบาดาล 1 บ่อ บ่อน้ำตื้น 1 บ่อ บ่อเลี้ยงปลา 1 บ่อโดยความร่วมมือจาก นพค.45 กรป.กลางสตูล
ปีการศึกษา 2537 ได้รับงบประมาณขุดบ่อน้ำตื้น 1 บ่อเป็นเงิน 17,000 บาทได้รับงบประมาณสร้างส้วมแบบ สปช.601/16 จำนวน 2 ที่นั่งเป็นเงิน 45,000 บาทสร้างป้ายโรงเรียนด้วยซีเมนต์ 1 ป้ายเป็นเงิน 6,000 บาท เดินสายไฟฟ้าในอาคารเรียนจำนวน 4 ห้องเรียนพร้อมติดตั้งอุปกรณ์ไฟฟ้าเป็นเงิน 6,800 บาท
ปีการศึกษา 2539 ได้รับเป็นโรงเรียนในโครงการปฏิรูปการศึกษา
ปีการศึกษา 2541 ได้รับงบประมาณจัดทำห้องปฏิบัติการทางภาษา และห้องวิทยาศาสตร์
ปีการศึกษา 2548 กรมทรัพยากรธรณีวิทยาได้เจาะบ่อบาดาลให้จำนวน 1 บ่อ