โรงเรียนบ้านควนต่อ ตั้งขึ้นเมื่อวันที่ ๖ กรกฎาคม  ๒๔๘๒   มีเนื้อที่ทั้งหมด  ๖ ไร่  ๗๕  ตารางวา  เปิดสอนครั้งแรกตั้งแต่ชั้นประถมศึกษาปีที่ ๑  ถึง  ชั้นประถมศึกษาปีที่ ๔  ในปีการศึกษา  ๒๕๒๑ ทางราชการขยายการศึกษาภาคบังคับ เปิดสอนถึงชั้นประถมศึกษาปีที่ ๖  ในปีการศึกษา  ๒๕๓๐ ทางโรงเรียนได้ขอเปิดสอนระดับก่อนประถมศึกษา    และในปีการศึกษา  ๒๕๓๖  ทางโรงเรียนสอนระดับมัธยมศึกษาตอนต้น   ปัจจุบัน ทางโรงเรียนได้จัดการศึกษาเป็น  ๓  ระดับ คือ ระดับปฐมวัย   ระดับประถมศึกษา   และระดับมัธยมศึกษาตอนต้น  มีนักเรียน  ๒๓๕ คน  รวม  ๑๑  ห้องเรียน ผู้บริหาร ๑ คน ข้าราชการครู  ๑๕ คน วิทยากรอิสลาม ๑ คน ช่างปูน ระดับ ช ๓  ๑  คน  เจ้าหน้าที่ธุรการ  ๑ คน