โรงเรียนบ้านบกเก้าห้องตั้งขึ้นเมื่อพ.ศ. ๒๕๘๒ อาจารย์ไพศาล  บุญยัง ได้บริจาคที่ดินประมาณ ๓๒ ไร่ เป็นที่ตั้งของโรงเรียน นายแดง สุวรรณ กำนันตำบลเขาเขนร่วมกับราษฎรได้ช่วยกันสร้างอาคารเรียนชั่วคราง ๑ หลัง ขนาด ๙ × ๑๘ เมตร ๒ ห้องเรียนหลังคามุงจากกั้นฝาขัดแตะ ได้เปิดทำการสอนตั้งแต่ชั้นประถมศึกษาปีที่ ๑ ถึงชั้นประถมศึกษาปีที่ ๔ ต่อมาวันที่ ๑๘ กันยายน ๒๕๐๒ อาคารเรียนชั่วคราวถูกพายุพัดเสียหายไม่สามารถที่จะใช้เป็นสถานที่เรียนของนักเรียนได้  ด้วยเหตุนี้  นายล้อม  มาลาทอง กำนันตำบลเขาเขน  คนต่อมาพร้อมด้วยราษฎรได้ร่วมกันสร้างอาคารเรียนชั่วคราวขนาด ๙ × ๑๘ เมตรจำนวน ๒ ห้องเรียน หลังคามุงจากกั้นฝาแตะเมื่อวันที่ ๒๖ ตุลาคม ๒๕๐๕ อาคารเรียนที่ถูกวาตภัยพัดเสียหายอีก                                    

ดังนั้นนายจเร  ศิวเถาว์ ครูใหญ่พร้อมด้วยราษฎรได้ช่วยกันสร้างอาคารเรียนชั่วคราวขึ้นมาใหม่อีก ๑ หลัง ขนาด ๙ × ๑๖ เมตร หลังคามุงจากกั้นฝาขัดแตะและต่อมาทางราชการได้จัดสรรงบประมาณในการสร้างอาคารเรียนถาวรให้ ๑ หลัง แบบวาตภัย ๓ ห้องเรียน  หลังคามุงสังกะสี  กั้นฝากระดาน  แต่ขาดพื้น ประตู  หน้าต่าง

ต่อมาในปี พ.ศ. ๒๕๐๗ ทางราชการได้จัดสรรพเงินงบประมาณสร้างเพิ่มเติมในสิ่งที่ยังค้างคาอยู่จนสำเร็จและในปี พ.ศ. ๒๕๐๗ ทางราชกาลได้จัดสรรเงินงบประมาณเพิ่มเติมในสิ่งที่ยังค้างคาอยู่จนสำเร็จและในปี พ.ศ. ๒๕๑๓ นายนับ   มาลาทอง   ครูใหญ่ได้ร่วมกับข้าราชการในอำเภอปลายพระยา ได้ต่อเติมอาคารเรียนแบบ ป.๑ ก ๑ ห้องเรียน โดยต่อเดิมอาคารเรียนหลังวาตภัย

 ปี พ.ศ. ๒๕๑๖ ได้งบประมาณสร้างอาคารเรียนแบบ ๐๐๘ จำนวน ๑ หลัง ๔ ห้องเรียน

ปี พ.ศ. ๒๕๑๙ ได้งบประมาณสร้างอาคารเรียนแบบ ป.๑ ก จำนวน ๑ หลัง ๒ ห้องเรียน

ปี พ.ศ. ๒๕๒๑ได้งบประมาณสร้างอาคารเรียนแบบ ๐๐๘ จำนวน ๓  ห้องเรียน ซึ่งต่อเติมจากอาคารเดิม

ปี พ.ศ. ๒๕๓๘   ได้รับอนุญาตให้รื้อถอนอาคารเรียนแบบ ป.๑ ก จำนวน ๑ ห้องเรียนและอาคารแบบวาตภัย ๓ ห้องเรียน เนื่องจากชำรุดทรุดโทรมมาก

ปี พ.ศ. ๒๕๔๐ ได้งบประมาณสร้างอาคารแบบ สปช.  ๑๐๕/๒๙ จำนวน ๑ หลัง ๔ ห้องเรียน                        ปัจจุบันโรงเรียนมีอาคารประกอบ  ดังนี้  

                ๑. บ้านพักครู ๑ หลัง

                ๒. อาคารเอนกประสงค์  ๒ หลัง

                ๓. ห้องส้อม  ๓ หลัง๑๐ ที่นั่ง

โรงเรียนบ้านบกเก้าห้อง  เปิดทำการสอนระดับชั้นประถมศึกษาปีที่ ๑ – ชั้นประถมศึกษาปีที่ ๖ มีนักเรียนจำนวน 75 คน มีข้าราชการครู 4 คน ครูช่วยสอน ๑ คน ครูจ้างสอน 3 คน ครูพี่เลี้ยงเด็กพิการ 1 คน ครูธุรการ 1 คน