โรงเรียนไทยรัฐวิทยา ๕๓ (บ้านคลองขนาน) ตั้งเมื่อวันที่ ๑๖ เมษายน ๒๔๙๑ โดยราษฎรหมู่ที่ ๓ และ ๖ ได้ร่วมกันสละวัสดุอุปกรณ์ในการก่อสร้างโรงเรียนบ้านคลองท่อมใต้ วันที่ ๖ เมษายน ๒๔๙๒ กระทรวงได้อนุญาตให้เป็นเอกเทศ ชื่อโรงเรียนบ้านคลองขนาน  เปิดสอนตั้วแต่ ป.๑ - ป.๔

      ปีงบประมาณ ๒๕๑๖ ได้รับงบประมาณสร้างบ้านพักครู ๑ หลัง งบประมาณ ๔๕,๐๐๐ บาท

      ปีงบประมาณ ๒๕๑๘ ได้รับงบประมาณสร้างอาคารเรียนแบบ ป.๑ ก.๓ ห้องเรียน งบประมาณ ๑๒๐,๐๐๐ บาท

      ปีงบประมาณ ๒๕๒๐ ได้รับงบประมาณ สร้างบ้านพักครู ๑ หลัง ๓ ห้อง ๒ ชั้น งบประมาณ ๗๐,๐๐๐ บาท และทางองค์การไฟฟ้าฝ่ายผลิตจังหวัดกระบี่ ได้บริจาคสร้างเสาธงถาวรให้ ๑ ชุด เป็นเงิน ๘,๐๐๐ บาท

      ปีงบประมาณ ๒๕๒๓ ได้รับงบประมาณสร้างอาคารเรียนแบบป .๑ก จำนวน ๔ ห้องเรียน งบประมาณ ๖๐๐,๐๐๐ บาท พร้อมโรงอาหาร ๑ ห้อง

      ปีงบประมาณ ๒๕๒๙ มูลนิธิหนังสือพิมพ์ไทยรัฐ สร้างอาคารแบบ สปช.๑๐๕/๒๖ ให้ ๑ หลัง ๔ ห้องเรียน พร้อมโต๊ะ เก้าอี้ ม้านั่งนักเรียน ๑๖๐ ชุด งบประมาณทั้งสิ้น ๑,๐๗๘,๔๘๘ บาทและทำพิธีมอบโรงเรียน เมื่อวันที่ ๒ มิถุนายน ๒๕๒๙ เวลา ๑๓,๓๐ น. โดยนายสัมพันธ์ ทองสมัคร รัฐมนตรีว่าการกระทรวงศึกษาธิการ เป็นผู้รับมอบ และได้รับมอบเงินจากมูลนิธิหนังสือพิมพ์ไทยรัฐ จำนวน ๒๐๐,๐๐๐ บาท เพื่อจัดเป็นมูลนิธไทยรัฐวิทยา ๕๓ (บ้านคลองขนาน) และเปลี่ยนชื่อเป็นโรงเรียนไทยรัฐวิทยา ๕๓ (บ้านคลองขนาน)

        ปีงบประมาณ ๒๕๓๓ มูลนิธิหนังสือพิมพ์ไทยรัฐได้ให้งบประมาณต่อเติมชั้นล่างอาคารเรียน ๑๐๕/๒๖ อีก ๔ ห้องเรียน

        ปีงบประมาณ ๒๕๓๖ ได้รับงบประมาณจาก สปช. สร้างอาคารเอนกประสงค์แบบ ๒๐๓/๒๖ จำนวน ๑ หลัง

        นายเจริญ ช่วยเกิด มารับตำแหน่งที่โรงเรียนไทยรัฐวิทยา ๕๓ (บ้านคลองขนาน) เมื่อวันที่ ๒๘ พฤศจิกายน ๒๕๓๘ ย้ายมาจากโรงเรียนบ้านคลองปิ้ง สปอ.คลองท่อม สปจ.กระบี่

        นายสวาสดิ์  ขนานใต้  ตำแหน่งผู้อำนวยการโรงเรียนไทยรัฐวิทยา ๕๓ (บ้านคลองขนาน)  ตั้งแต่  พ.ศ. ๒๕๕๒  ถึงปัจจุบัน

       ปัจจุบันโรงเรียนไทยรัฐวิทยา ๕๓ (บ้านคลองขนาน) เปิดทำการสอน ตั้งแต่ชั้นอนุบาล ๑ - ป.๖ มีนักเรียน ๒๐๑ คน ครู ๑๕ คน  พนักงานบริการ ๑ คน ครูพี่เลี้ยงเด็กพิการ ๑ คน ห้องเรียน ๑๑ ห้อง