โรงเรียนบ้านกุยเหนือ เปิดดำเนินการสอนครั้งแรกเมื่อวันที่ 19 พฤศจิกายน 2502 ด้วยความร่วมมือของชุมชน โดยมีผู้นำชุมชนที่ร่วมดำเนินการก่อตั้ง คือ
1. พระอธิการชู เจ้าอาวาสวัดควนส้าน
2. นายมี จันทร์เมือง ศึกษาธิการอำเภอฉวาง
3. นายข้อย จันทร์เมือง ผู้นำชุมชน
4. นายนาค นวลศรี ผู้อุทิศที่ดิน
เปิดจัดการเรียนการสอน ตั้งแต่ปีการศึกษา 2502 จนถึงปัจจุบัน ปีการศึกษา 2569 โรงเรียนบ้านกุยเหนือ ได้จัดการศึกษามาแล้ว 57 ปี โดยดำเนินการจัดการศึกษาในสองระดับ คือ ระดับก่อนประถมศึกษา และระดับประถมศึกษา มีผู้บริหารโรงเรียนจนถึงปัจจุบัน จำนวน 7 คน
1. นายเฉลียว สังขวรรณ ดำรงตำแหน่งตั้งแต่ พ.ศ. 2502 – พ.ศ. 2518
2. นายเกลื่อน นามสนธิ์ ดำรงตำแหน่งตั้งแต่ พ.ศ. 2518 – พ.ศ. 2532
3. นายวรศักดิ์ เพชรลิ ดำรงตำแหน่งตั้งแต่ พ.ศ. 2532 – พ.ศ. 2534
4. นายมังกรแก้ว ดรุณศิลป์ ดำรงตำแหน่งตั้งแต่ พ.ศ. 2534 – พ.ศ. 2538
5. นายบุญเลิศ ขวัญนิมิตร ดำรงตำแหน่งตั้งแต่ พ.ศ. 2538 – พ.ศ. 2551
6. นางสาวอัญชลี นามสนธิ์ ดำรงตำแหน่งตั้งแต่ พ.ศ. 2551 – พ.ศ.2563
7. นายเจตน์ วรรณเริก ดำรงตำแหน่งตั้งแต่ 25 มิถุนายน พ.ศ. 2563 – ปัจจุบัน
พ.ศ. 2554 สำนักงานรับรองมาตรฐานและประเมินคุณภาพการศึกษา (องค์การมหาชน) ได้มาประเมินคุณภาพภายนอกรอบสาม ( พ.ศ. 2554 – 2558 ) ได้รับรองมาตรฐานการศึกษาทั้งระดับก่อนประถมศึกษา และระดับประถมศึกษา
พ.ศ. 2555 โรงเรียนได้รับแจ้งให้ประชาสัมพันธ์การจัดการศึกษาที่รับรองมาตรฐานการศึกษาทั้งระดับก่อนประถมศึกษา และระดับประถมศึกษาสู่สาธารณชน จากสำนักงานรับรองมาตรฐานและประเมินคุณภาพการศึกษา (องค์การมหาชน)
พ.ศ. 2556 โรงเรียนบ้านกุยเหนือ มี จำนวนนักเรียนเพิ่มขึ้นจำนวน 130 คน ได้รับอัตรากำลังครูเพิ่มขึ้น 2 คน จากปรับเปลี่ยนจากโรงเรียนขนาดเล็กเป็นโรงเรียนขนาดกลาง
พ.ศ. 2557 โรงเรียนบ้านกุยเหนือ มี จำนวนนักเรียนเพิ่มขึ้นจำนวน 131 คน เป็นโรงเรียนขนาดกลางได้รับอัตรากำลังครูเพิ่มขึ้นจากปีการศึกษา 2557 อีก 1 คน ปีนี้ ได้รับจัดสรรงบประมาณจากสำนักงานคณะกรรมการการศึกษาขั้นพื้นฐาน (สพฐ.) ให้สร้างอาคารเรียน 105/29 จำนวน 5 ห้องเรียน ข้างบน 4 ห้องเรียน ข้างล่าง 1 ห้องเรียน งบประมาณ 3,613,100 บาท แทน อาคาร ป 1 ก.
พ.ศ. 2558 โรงเรียนบ้านกุยเหนือ มีนักเรียนจำนวน 151 คน ได้เข้าร่วมโครงการเด็กไทยแก้มใส โดยโรงเรียนบ้านกุยเหนือได้รับงบประมาณสนับสนุนจากสำนักงานกองทุนสนับสนุนการสร้างเสริมสุขภาพ กรมอนามัย กระทรวงสาธารณสุข จำนวน 60,000 บาท และได้รับคัดเลือกให้ดำเนินการต่อในปีที่ 2 ในโครงการศูนย์เรียนรู้ต้นแบบโรงเรียนเด็กไทยแก้มใส ได้รับงบประมาณสนับสนุนในปีที่ 2 จำนวน 100,000 บาท
พ.ศ. 2559 โรงเรียนบ้านกุยเหนือ มีนักเรียนจำนวน 137 คน ได้รับการสนับสนุนจากคณะกรรมการสถานศึกษา ศิษย์เก่าโดยการทอดผ้าป่าสามัคคี เพื่อนำงบประมาณมาพัฒนาโรงเรียนให้เป็นศูนย์การเรียนรู้ของชุมชน และโรงเรียนได้เข้าร่วมโครงการส่งเสริมสุขภาพ เพื่อประเมินสู่ระดับเพชร ได้รับงบประมาณ จากการทอดผ้าป่าสามัคคี จำนวน 210,000 บาท
พ.ศ. 2560 โรงเรียนบ้านกุยเหนือ มีนักเรียนจำนวน 112 คน โรงเรียนได้เข้ารับรางวัลโรงเรียนต้นแบบนักเรียนไยสุขภาพดีรุ่นที่ 5 ปีการศึกษา 2560 และรางวัลต้นแบบอาหารกลางวันระดับประเทศดีเด่น
พ.ศ. 2561 โรงเรียนบ้านกุยเหนือ มีนักเรียนจำนวน 105 คน นักเรียนโรงเรียนมีผลการทดสอบผลสัมฤทธิ์ทางการเรียนระดับชาติ O-Net ชั้นประถมศึกษาปีที่ 6 สูงกว่าระดับประเทศ ร้อยละ 6.1 ผลสัมฤทธิ์ทางการเรียนระดับชาติ Nt ชั้นประถมศึกษาปีที่ 3 สูงกว่าระดับประเทศ ร้อยละ 21.94
พ.ศ. 2562 โรงเรียนบ้านกุยเหนือ มีนักเรียนจำนวน 86 คน นักเรียนโรงเรียนมีผลการทดสอบผลสัมฤทธิ์ทางการเรียนระดับชาติ O-Net ชั้นประถมศึกษาปีที่ 6 สูงกว่าระดับประเทศ ร้อยละ 0.11 ผลสัมฤทธิ์ทางการเรียนระดับชาติ Nt ชั้นประถมศึกษาปีที่ 3 สูงกว่าระดับประเทศ ร้อยละ 7.44
พ.ศ. 2563 โรงเรียนบ้านกุยเหนือ มีนักเรียนจำนวน 76 คน นักเรียนโรงเรียนมีผลการทดสอบผลสัมฤทธิ์ทางการเรียนระดับชาติ O-Net ชั้นประถมศึกษาปีที่ 6 สูงกว่าระดับประเทศ ร้อยละ 19.11 ผลสัมฤทธิ์ทางการเรียนระดับชาติ Nt ชั้นประถมศึกษาปีที่ 3 สูงกว่าระดับประเทศ ร้อยละ 12.56
พ.ศ. 2564 โรงเรียนบ้านกุยเหนือได้รับแจ้งให้ประชาสัมพันธ์การจัดการศึกษาที่รับรองมาตรฐานการศึกษาทั้งระดับก่อนประถมศึกษา และระดับประถมศึกษาสู่สาธารณชน จากสำนักงานรับรองมาตรฐานและประเมินคุณภาพการศึกษา (องค์การมหาชน)
พ.ศ. 2565 โรงเรียนบ้านกุยเหนือได้ผ่านการประเมินรอบที่สอง บ้านนักวิทยาศาสตร์น้อย ประจำปีการศึกษา 2563-2565 จากมูลนิธิสมเด็จพระเทพรัตนราชสุดา
พ.ศ. 2568 โรงเรียนบ้านกุยเหนือได้รับแจ้งให้ประชาสัมพันธ์การจัดการศึกษาที่รับรองมาตรฐานการศึกษาทั้งระดับก่อนประถมศึกษา และระดับประถมศึกษาสู่สาธารณชน จากสำนักงานรับรองมาตรฐานและประเมินคุณภาพการศึกษา (องค์การมหาชน)