โรงเรียนวัดสองพี่น้องได้ทำการเปิดเมื่อวันที่ 19 สิงหาคม 2482 พระคง  กสฺสโป  เจ้าอาวาสวัดสองพี่น้องในขณะนั้น นายสุย  ธรรมชาติ  กำนันตำบลหุล่อง นายกล่อม  สุวรรณรัตน์ ผู้ใหญ่บ้ายหมู่ที่ 6 ตำบลหูล่อง นายอุ่น  หอสังข์ ผู้ใหญ่บ้านหมู่ 5 ตำบลหูล่อง นายยกห้อง สุวรรณรัตน์  ได้ร่วมกันสนับสนุนก่อตั้งโรงเรียน  โดยใช้อาคารศาลาวัด 1 หลัง ขนาด 7x8 ตารางวา พื้นถมดิน หลังคามุงกระเบื้องดินเผา ใช้เป็นอาคารเรียนหลังแรก  โดยใช้ชื่อตอนแรกว่าโรงเรียนประชาบาลหูล่อง 2(วัดสองพี่น้อง) เปิดสอนตั้งแต่ชั้นประถมศึกษาปีที่ 1 ถึงชั้นประถมศึกษาปีที่ 4 นายเขียน  ช่วยประดิษฐ์ เป็นครูใหญ่คนแรก

         พ.ศ.2486 ตำบลหูล่อง ถูกยุบรวมกับตำบลบางทวด โรงเรียนจึงถูกเปลี่ยนชื่อเป็น โรงเรียนประชาบาลตำบลบางทวด 2 (วัดสองพี่น้อง)

        พ.ศ.2492 ทางราชการได้แยกตำบลหูล่องออกเป็นเอกเทศเหมือนเดิมโรงเรียนจึงได้  กลับมาเปลี่ยนชื่อเป็นโรงเรียนประชาบาลตำบลหูล่อง 2 (วัดสองพี่น้อง) อีกครั้งหนึ่ง มีเนื้อที่ 4 ไร่ 1 งาน 87 ตารางวา

         พ.ศ.2495 ได้เปลี่ยนชื่อเป็นโรงเรียนวัดสองพี่น้อง

         พ.ศ.2505 เมื่อ 25 ตุลาคม 2505 ได้เกิดวาตภัยในพื้นที่จังหวัดนครศรีธรรมราช อย่างรุนแรง โดยเฉพาะที่แหลมตะลุมพุก อำเภอปากพนัง เป็นผลทำให้ประชาชนล้มตาย และสูญหายจำนวนมาก บ้านเรือนราษฎรได้รับความเสียหาย โรงเรียนได้รับผลกระทบมาเช่นกัน ทางราชการได้ให้งบมาซ่อมแซมอาคารจำนวน 600 บาท (หกร้อยบาทถ้วน)

         พ.ศ.2512 กรมการปกครอง กระทรวงมหาดไทย ได้จัดสรรงบประมาณสร้างอาคารเรียน แบบ ป.1 ข. จำนวน 1หลัง ขนาด 8.50 x 27 เมตร 3 ห้องเรียน เป็นเงิน 120,000 บาท สร้างเสร็จเมื่อเดือนกุมภาพันธ์ 2513 คืออาคารเรียน 1 ที่ได้รื้อถอนไปแล้ว

         พ.ศ.2519 โรงเรียนได้เปิดขยายโอกาสทางการศึกษาถึงชั้นประถมศึกษาปีที่ 7  ทำให้อาคารไม่เพียงพอราษฎรจึงบริจาคทรัพย์และสร้างอาคารเรียนชั่วคราวขนาด 8 x50 x16 เมตร จำนวน 2 ห้องเรียน 1 หลังพื้นถมดินหลังคามุงจากคิดเป็นเงิน13,000บาทขณะนี้รื้อถอน

ไปแล้ว

         พ.ศ.2520 เปิดสอนชั้นประถมศึกษาปีที่ 5 รุ่นแรก

         พ.ศ.2522 ได้รับงบประมาณสร้างอาคารเรียนแบบ ป.1 ข. 1 หลัง ขนาด 8.50 x36 เมตร จำนวน 4 ห้องเรียน เป็นเงิน 400,000 บาท เริ่มก่อสร้างเมื่อ 8 มิถุนายน 2522 เสร็จเมื่อวันที่ 12 กันยายน 2522 คืออาคารเรียน 2 ในปัจจุบัน

         พ.ศ.2524 นายสุธรรม สุขคง ได้ย้ายมาดำรงตำแหน่งครูใหญ่ ได้รับงบประมาณสร้างอาคารประกอบ โรงฝึกงานแบบสามัญ 312 ขนาด 7 x14 เมตร 1 หลัง เป็นเงิน 150,000 บาท  สร้างเสร็จเมื่อวันที่ 22 กุมภาพันธ์ 2525 และได้รับงบประมารสร้างส้วม แบบ 401 กรมสามัญศึกษา 1 หลัง ขนาด 3 ที่นั่ง เป็นเงิน 110,000 บาท (หนึ่งแสนหนึ่งหมื่นบาทถ้วน) สร้างเสร็จเมื่อวันที่ 28 มีนาคม 2525

         พ.ศ.2525 ได้ขอย้ายกลุ่มโรงเรียนจากกลุ่มโรงเรียนท่าพญาไปสังกัดกลุ่มโรงเรียน

บ้านใหม่

         พ.ศ.2527 ได้รับงบประมาณต่อเติมอาคารเรียน แบบ ป.1ข. เพิ่มอีก 2 ห้องเรียน อาคารเรียน ป.1ข. เป็นเงิน 329,000 บาท สร้างเสร็จเมื่อวันที่ 1 สิงหาคม 2527

         พ.ศ.2531 ได้รับงบประมาณสร้างบ่อน้ำฝน แบบ ฝ.33 พิเศษ ชุด 4 ถัง เป็นเงิน 35,000

         พ.ศ.2534 เปิดขยายโอกาสทางการศึกษา ชั้น ม.1 ในวันที่ 16 พฤษภาคม 2534 เปิดเป็นโรงเรียนแรกของอำเภอ มีนักเรียน 71 คน  เปิดเป็น 2 ห้องเรียน  ในปีนี้ได้รับงบประมาณสร้างอาคารเรียน แบบ สป.8 105/29 1 หลัง 4 ห้องเรียน เป็นเงิน 1,400,000 บาท สร้างเสร็จเมื่อวันที่ 24 ตุลาคม 2534 คืออาคารเรียน 3 ในปัจจุบัน

         พ.ศ.2535 ได้รับงบประมาณสร้างอาคารเรียน แบบ สปช.105/29 1 หลัง 5 ห้องเรียน เป็นเงิน 1,779,000 บาท อาคารเรียน 4 ในปัจจุบัน

         พ.ศ.2536 เปิดขยายชั้นเรียนถึงชั้นมัธยมศึกษาปีที่ 3 ได้รับงบประมาณสมาชิกสภาผู้แทนราษฎร จำนวน 90,000 บาท สร้างสนามอเนกประสงค์ เสร็จเมื่อวันที่ 28 พฤศจิกายน 2536

         พ.ศ.2537 โรงเรียนได้รับงบประมาณ สร้างสนามบาสเก็ตบอล เป็นเงิน 128,000 บาท ส้วมแบบ สปช.603/29 จำนวน 1 หลัง 6 ที่นั่ง เป็นเงิน 135,000 บาท ส้วมแบบ สปช.603/29 จำนวน 1 หลัง 4 ที่นั่ง เป็นเงิน 90,000 บาท(เก้าหมื่นถ้วน) สร้างเสร็จเมื่อวันที่ 20 กุมภาพันธ์ 2537

         พ.ศ.2540 นายสรพันธ์  บุญถนอม  ตำแหน่งอาจารย์ใหญ่โรงเรียนวัดกาญจนาราม รักษาการในตำแหน่งผู้อำนวยการโรงเรียนวัดสองพี่น้อง

         พ.ศ. 2540  นายสุรชาติ  เจียมตน  ได้มารับตำแหน่งผู้อำนวยการโรงเรียนวัดสองพี่น้อง เมื่อวันที่  ๔ มิถุนายน  2540 

         พ.ศ.2542  นางอารอบ  ปรีดาศักดิ์  ตำแหน่งอาจารย์ 2  ระดับ 7 โรงเรียนวัดสองพี่น้อง เป็นผู้รักษาการในตำแหน่งผู้อำนวยการโรงเรียนวัดสองพี่น้อง  เมื่อวันที่  26 มกราคม 2542

         พ.ศ.2542  ได้รับงบประมาณต่อเติมอาคารเรียน 4 จำนวน 2 ห้องเรียน เป็นเงิน 292,000 บาท(สองแสนเก้าหมื่นสองพันบาทถ้วน)

         พ.ศ.2542  นางเสาวณีย์  ทิพย์วารี  ตำแหน่งอาจารย์ 1 โรงเรียนวัดฝ่าพระบาทราษฏร์บำรุง  เป็นผู้รักษาการในตำแหน่งผู้อำนวยการโรงเรียนวัดสองพี่น้อง  เมื่อวันที่   9 เมษายน 2542

         พ.ศ.2542  นายสุรพงศ์  ไชยสุวรรณ  ได้มารับตำแหน่งผู้อำนวยการโรงเรียนวัดสองพี่น้อง เมื่อวันที่ 12 เมษายน 2542

         พ.ศ.2542 ได้รับงบประมาณสร้างส้วม แบบ สปช.601/26 จำนวน 1 หลัง ขนาด 4 ที่นั่ง เป็นเงิน 111,000 บาท และได้ก่อสร้างอาคารประกอบ 1 ห้อง คือ ห้องพลศึกษางบบริจาค 80,000 บาท

         พ.ศ.2545 นางสุทธาทิพย์  คนซื่อ ได้มารับตำแหน่งผู้บริหารโรงเรียนวัดสองพี่น้อง เมื่อวันที่ 10 กันยายน 2545

         พ.ศ.2548 ได้รับงบประมาณซ่อมแซมอาคารเรียน และปรับปรุงระบบไฟฟ้า ปรับปรุงพื้นห้องเรียนปูกะเบื้องทุกห้องเรียน รวมเป็นเงิน 1,210,000 บาท  ในปีนี้ได้รับงบประมาณทาสีอาคารเรียน 2 หลังด้วย

         พ.ศ.2549 ได้รับเครื่องคอมพิวเตอร์จำนวน 5 เครื่อง จากองค์การบริหารส่วนจังหวัดนครศรีธรรมราช

         พ.ศ.2550 ได้รับงบประมาณซ่อมแซมอาคารเรียนปูกระเบื้องหน้าอาคารเรียน สปช.105/29 จำนวน 2 หลัง ปรับปรุงลานกีฬา และบริเวณโรงเรียนงบประมาณ 338,500 บาท

         พ.ศ.2551 ได้รับคอมพิวเตอร์จำนวน 15 เครื่อง จากองค์การบริหารส่วนจังหวัด

นครศรีธรรมราช

         พ.ศ.2551 นายวรวุธ เชาว์พ้อง  ได้มารับตำแหน่งผู้บริหารโรงเรียนวัดสองพี่น้อง เมื่อวันที่ 29 ธันวาคม 2551       

         พ.ศ.2558 นางสุจิณณา  มาบัว ได้มารับตำแหน่งผู้บริหารโรงเรียนวัดสองพี่น้อง  เมื่อวันที่ 31มีนาคม 2558

         พ.ศ.2559  นางสาวประทีป  มะลิแก้ว  ได้มารับตำแหน่งผู้บริหารโรงเรียนวัดสองพี่น้อง เมื่อวันที่  23  ธันวาคม  2559