โรงเรียนบ้านปากพญา เปิดทำการสอนเมื่อวันที่ ๑ มิถุนายน ๒๔๘๒ โดยเปิดทำการเรียนการสอน

ชั้นประถมศึกษาปีที่  ๑  ถึงชั้นประถมศึกษาปีที่  ๔  สถานที่ตั้งอยู่ในหมู่ที่  ๖  ตำบลท่าซัก อาคารเรียนเดิมเป็นสุเหร่า 

ต่อมาเกิดพายุพัดจนอาคารเรียนชำรุดทั้งหลัง คณะครูและชาวบ้านได้สร้างอาคารเรียนชั่วคราว สามารถจัดเป็น

ที่จัดการเรียนการสอนได้ถึง ๗ ปี ได้เกิดพายุพัดจนเสียหายทั้งหลังอีกครั้งในปี ๒๕๐๕ ต่อมาทางราชการ

ได้ให้เงินงบประมาณก่อสร้างอาคารเรียน นายเคียง กิจวิจิตร ครูใหญ่สมัยนั้นได้บริจาคที่ดินเป็นสถานที่ก่อสร้าง

ต่อมาทางราชการได้เงินงบประมาณในการก่อสร้างอาคารเรียนและอาคารประกอบหลายครั้ง อาคารสถานที่ได้รับ

การพัฒนาปรับปรุงเรื่อยมาอย่างสม่ำเสมอจนสามารถให้บริการ แก่ผู้เรียนในชุมชนอย่างพอเพียง  

ในปีการศึกษา ๒๕๒๓  ได้อาคารเรียนใหม่ก่อสร้างด้วยเงินงบประมาณ  ๓๙๐,๐๐๐ บาท ตามแบบ ป.๑ ข  ขนาด  ๓  ห้องเรียน   

โดยทำการก่อสร้างบนที่ดินที่นายเคียง  กิจวิจิตรบริจาคให้  เป็นเนื้อที่ ๒ ไร่ ๒ งาน ๓๕ ตารางวา

ปีพ.ศ. ๒๕๒๕ มัสยิดบ้านปากพญาบริจาคที่ดินให้อีก ๑ ไร่ ๑งาน ๕๐ ตารางวา รวมที่ดินของโรงเรียน ๓ ไร่ ๓ งาน ๘๕ ตารางวา

ในปีการศึกษา ๒๕๓๕ โรงเรียนได้รับการอนุมัติให้เปิดทำการสอนในระดับชั้นมัธยมศึกษาตอนต้น ตามโครงการการขยายโอกาสทางการศึกษา

โรงเรียนได้ดำเนินการจัดการเรียนการสอนตลอดมา โดยมี นายยุทธพล อักษรรัตน์ เป็นผู้อำนวยการโรงเรียนคนปัจจุบัน