โรงเรียนบ้านวังข่อย เดิมเป็นโรงเรียนสาขาของโรงเรียนบ้านห้วยมงคล ก่อตั้งขึ้นเมื่อ วันที่ 20 เมษายน 2520จากการร่วมแรงร่วมใจของชาวบ้านวังข่อยและชาวบ้านปุ่มมะค่า โดยการนำของผู้ใหญ่บ้าน ชื่อนายแหว่ว เอี่ยมศิริพร้อมคณะชาวบ้านได้ช่วยกันจัดการวัสดุในการปลูกสร้าง สร้างเป็นอาคารชั่วคราวขนาดกว้าง 9.0 เมตร ยาว 15.0 เมตร ฝาและหลังคามุงด้วยสังกะสี ตั้งอยู่ห่างจากถนน ร.พ.ช. ประมาณ 500 เมตรเริ่มเปิดทำการสอนเมื่อวันที่ 17 มกราคม 2520 มีนักเรียนทั้งสิ้น 84 คน ชาย 38 คน หญิง 46 คน มีนายวิชัย ทองเกลี้ยง ครูโรงเรียนบ้านหนองขอนมารักษาการในตำแหน่งครูใหญ่ นายปัญญา วงศ์ชื้น ครูโรงเรียนบ้านหนองพรานพุกนางสาวทรรศวร เกิดสวัสดิ์ ครูโรงเรียนบ้านห้วยมงคล มาช่วยทำการสอน
ต่อมาหมวดการศึกษาอำเภอหัวหิน เห็นว่าที่ตั้งโรงเรียนอยู่ห่างจากถนนเกินไปทางโรงเรียนจึงดำเนินการเรื่องขอแลกที่ดินกับชาวบ้านซึ่งอยู่ติดกับถนน มีเนื้อที่ 8 ไร่ 70 ตารางวา และยังได้ติดต่อกับศูนย์การทหารราบค่ายธนะรัชต์ อำเภอปราณบุรี เพื่อขอรถ 2 คัน กับรถชาวบ้านอีก 4 คัน มาช่วยกันปรับพื้นที่ซึ่งเป็นจอมปลวกใหญ่ซึ่งมีอยู่มากใช้เวลา 2 วัน จึงทำการปรับพื้นที่ให้พอที่จะตั้งอาคารเรียนได้ ชาวบ้านจึงได้มาช่วยกันรื้ออาคารเดิมมาปลูกใหม่ ใช้เวลา 5 วัน จึงแล้วเสร็จ ได้ทำพิธีเปิดอาคารเรียนหลังใหม่ เมื่อวันที่ 1 กรกฎาคม 2520โดยมีหัวหน้าหมวดการศึกษามาเป็นประธานเปิด ในวันนั้นได้มีผู้บริจาคโต๊ะครู 3 ชุด กับถังน้ำฝนจำนวน 3 ใบ
ต่อมาทางราชการได้กำหนดว่าโรงเรียนที่จะจัดตั้งควรมีเนื้อที่อย่างน้อย 1 ไร่ขึ้นไปพร้อมกับมีอาคาร 1หลัง จึงตั้งเป็นโรงเรียนได้ ดังนั้นโดยการนำของผู้ใหญ่แหว่ว เอี่ยมศิริ พร้อมคณะกรรมการศึกษาและประชาชนในท้องถิ่นได้รวบรวมเงินได้ 120,000 บาท (หนึ่งหมื่นสองพันบาทถ้วน) ซื้อที่ดินได้อีก 3 ไร่ พร้อมกันนี้ได้ติดต่อกับบริษัทสัปปะรดกระป๋องไทย (ไต้หวัน) มาช่วยออกทุนทรัพย์เพื่อสร้างอาคารเรียนแบบถาวรให้อีก 1 หลัง มีจำนวนห้องเรียน 4 ห้อง ตัวอาคารมีขนาดกว้าง 8.5 เมตร ยาว 36 เมตร พร้อมส้วมอีก 1 หลัง มี 5 ห้อง ขนาดกว้าง 1.5 เมตร ยาว 5 เมตร เริ่มก่อสร้างเมื่อวันที่ 31 พฤษภาคม พ.ศ. 2521 ทางราชการได้ส่งนางจรรยา ส้มเขียวหวาน มาเป็นครูใหญ่แทน นายวิชัย ทองเกลี้ยง ซึ่งย้ายกลับโรงเรียนเดิม ปี พ.ศ. 2522 จังหวัดประจวบคีรีขันธ์ได้จัดสรรงบประมาณสร้างอาคารเรียนให้ 1 หลัง จำนวน 5 ห้องเรียน เป็นอาคารแบบ ป.1จ ใช้งบประมาณทั้งสิ้น 400,000 บาท (สี่แสนบาทถ้วน) พร้อมสร้างบ้านพักครูตามแบบองค์การบริหารส่วนจังหวัดในวงเงิน 85,000 บาท (แปดหมื่นห้าพันบาทถ้วน)
ปี พ.ศ. 2525 นายสำเภา ประจวบเหมาะ สมาชิกสภาจังหวัดประจวบคีรีขันธ์ ได้บริจาคทรัพย์สร้างบ่อน้ำบาดาล เป็นเงิน 45,000 บาท (สี่หมื่นห้าพันบาทถ้วน) และซื้อคอนกรีต 48,250 บาท (สี่หมื่นแปดพันสองร้อยห้าสิบบาทถ้วน)
ปี พ.ศ. 2526 ได้งบประมาณจากทางราชการสร้างอาคารเอนกประสงค์ แบบ สปช. 202/26 เป็นเงิน 200,000 บาท (สองแสนบาทถ้วน) และส้วมแบบ สปช. 601/26 เป็นเงิน 40,000 บาท (สี่หมื่นบาทถ้วน)
ปี พ.ศ. 2527 ได้รับจัดสรรงบประมาณสร้างอาคารเรียนแบบ สปช. 102/26 อีกหนึ่งหลัง จำนวน
2 ห้องเรียน เป็นเงิน 280,000 บาท (สองแสนแปดหมื่นบาทถ้วน)
ปี พ.ศ. 2528 ได้งบประมาณสร้างเรือนเพาะชำแบบ พ.1 จำนวน 1 หลัง เป็นเงิน 15,000 บาท (หนึ่งหมื่นห้าพันบาทถ้วน)
ปี พ.ศ. 2529 ได้งบประมาณติดตั้งไฟฟ้าโรงเรียนเมื่อวันที่ 1 พฤษภาคม 2531 ทางราชการส่ง
นายประยูร คล้ายจำลอง มาเป็นอาจารย์ใหญ่แทนนายนิเซะ มากาเจ
ปี พ.ศ. 2532 กำนันแหว่ว เอี่ยมศิริ พร้อมคณะได้จัดสร้างหอถังน้ำประปาโรงเรียนตามแบบของกรมอนามัยซึ่งมีถังเป็นคอนกรีตเสริมเหล็ก 1 ที่
ปี พ.ศ. 2533 ได้งบประมาณสร้างถังน้ำฝน แบบ ฝ.30 พิเศษ จำนวน 1 ที่ 3 ถัง เป็นเงิน 48,500 บาท (สี่หมื่นแปดพันห้าร้อยบาทถ้วน) สร้างเสร็จเมื่อวันที่ 12 กรกฎาคม 2533
เมื่อวันที่ 25 กรกฎาคม 2534 บริษัทมาเจสติค ครีกคันทรีคลับได้มาให้ความอนุเคราะห์บริจาคห้องสมุดตามโครงการห้องสมุดคิดเป็นมูลค่า 55,000 บาท (ห้าหมื่นห้าพันบาทถ้วน) ทางโรงเรียนได้ดำเนินการสร้างและได้รับมอบโดยตัวแทน นายอำเภอจากบริษัทเรียบร้อยเมื่อวันที่ 13 กันยายน 2538
ต่อมาเมื่อปี พ.ศ. 2536 ได้สร้างโรงเก็บรถนักเรียน โดยการนำของนางรัตนาภรณ์ เพิ่มยศ ซึ่งได้รับความอุปการะจากบริษัทเดอะมาเจสติก ครีก และ นางบุศรา เถาลิปโป้ สร้างเตาเผาขยะบริจาคให้แก่ทางโรงเรียน 1 ที่ โดยไม่ได้ใช้เงินงบประมาณของทางราชการทั้งสองรายการ นายแหว่ว เอี่ยมศิริ กำนันตำบลทับใต้ และบริษัทเดอะมาเจสติกนำดินมาถมสนามให้แก่ทางโรงเรียน พร้อมปรับพื้นที่ให้เรียบร้อยและใช้การได้ดี
เมื่อวันที่ 24 กรกฎาคม 2538 นายอมรรัตน์ ม่วงสกุล ได้บริจาคโรงอาหารให้ 1 หลัง เป็นคอนกรีตโครงเหล็ก เป็นเงินค่าก่อสร้าง จำนวน 100,000 บาท (หนึ่งแสนบาทถ้วน)
เมื่อปี 2548 โรงแรมฮิลตันได้บริจาคเงินจำนวน 115,000 บาท เพื่อสร้าง อาคารห้องสมุดให้แก่โรงเรียน จำนวน 1 หลัง และส้วม จำนวน 1 หลัง มี 3 ห้อง และทำการทาสีอาคารเรียนที่ 1 พร้อมบริจาคอาหารและเครื่องเขียนจำนวนหนึ่ง
เมื่อวันที่ 5 ธันวาคม 2549 ชาวบ้านได้ร่วมกันจัดสร้าง โรงเก็บรถครูจำนวน 1 หลัง โดยจัดงบประมาณมาเอง ประมาณ 10,000 บาท
ปี 2550 คณะกรรมการสถานศึกษาขั้นพื้นฐานของโรงเรียนบ้านวังข่อยและชุมชนพร้อมคณะครู
ได้จัดสร้างโรงจอดรถให้โรงเรียน 1 หลัง เป็นเงิน 20,000 บาท
ปี 2551 คณะกรรมการสถานศึกษาขั้นพื้นฐานของโรงเรียนบ้านวังข่อยและชุมชนได้จัด
ทอดผ้าป่าการศึกษา ได้เงินจำนวน 100,000 บาท แล้วนำเงินไปสร้างกำแพงโรงเรียนจนเสร็จเรียบร้อย
ปี 2551 องค์การบริหารส่วนตำบลทับใต้ ได้ขอห้องเรียนเพื่อเปิดศูนย์เด็กเล็ก 3 ขวบ
1 ห้องเรียน โดยส่งผู้ดูแลเด็กเล็กจำนวน 2 คน
ปีการศึกษา 2552 โรงเรียนได้ปูกระเบื้องอีก 5 ห้อง คือ ห้องพยาบาล ห้อง ป.1 -3 และห้องพิเศษ โดยใช้งบประมาณในการจัดงานโรงเรียนประจำปี
ปีการศึกษา 2553 บริษัท อุตสาหกรรมสับปะรดกระป๋องไทย จำกัด โดยโครงการพัฒนาชุมชนโรงเรียนของหนูได้ให้ความอนุเคราะห์ปรับปรุงอาคารเรียนที่ 2 เปลี่ยนฝ้า เพดาน 3 ห้องเรียน ได้แก่ ห้องสื่อ ห้องเรียนแหล่งเรียนรู้ห้องคอมพิวเตอร์ จำนวน ตารางเมตร (เหมาค่าแรงและค่าอุปกรณ์ ทาสีฝ้า สีขาวจำนวน 162 ตารางเมตร เปลี่ยนรางน้ำฝนความยาว 60 เมตร มอบเครื่องคอมพิวเตอร์ จำนวน 5 ชุด เมื่อวันที่ 30 สิงหาคม - 16 กันยายน 2553
ปีการศึกษา 2554 ได้ทำประตูเปิด-ปิด หน้าโรงเรียน จำนวน 1 ชุด โดยใช้เงินในการจัดงานโรงเรียน
ปีการศึกษา 2554 ได้รับความอนุเคราะห์ จากคุณ Mario และคุณอ้อน จัดทำห้องเก็บเครื่องกรองน้ำ
พร้อมเครื่องกรองน้ำให้โรงเรียนจำนวน 1 ชุด
ปีการศึกษา 2555 ปูกระเบื้อง ห้องคอมพิวเตอร์และได้รับคอมพิวเตอร์ จำนวน 5 ชุด
ปีการศึกษา 2556สร้างถนนคอนกรีตเสริมเหล็กในโรงเรียน งบประมาณ ก่อสร้าง 254,000
ปีการศึกษา 2557 ซ่อมแซม ฝาผนังอาคารเรียน แบบ ป1จ (2522) งบประมาณ 100,000
ปีการศึกษา 2558 ปูกระเบื้อง อาคารเรียน แบบ ป1 จ งบประมาณ 247,500
ปีการศึกษา 2558 ซ่อมแซมฝาผนังอาคารแบบ ป1 จ (เพิ่มเติมจากปี การศึกษา 2557) งบประมาณ 100,000
ปีการึกษา 2559 จัดทำก๊าชีวภาพ ไม่ีงบปรมาณ
ปัจจุบันโรงเรียนบ้านวังข่อยมีนักเรียนทั้งสิ้น 87 คน ครูประจำการ 6 คน ครูอัตราจ้าง 2 คน ช่างไม้ ช4 1 คน