โรงเรียนบ้านโตนดน้อย  ตั้งเมื่อวันที่ 23 เมษายน พ.ศ. 2484  โดยขุนประจันทร์ราษฏร์บริการ นายอำเภอหนองจอกเป็นผู้สร้าง เดิมโรงเรียนมีชื่อว่า โรงเรียนประชาบาล ตำบล หนองจอกบ้านโตนดน้อย ดำรงอยู่ด้วยเงินช่วยการประถมศึกษา งบประมาณของกระทรวงศึกษาธิการ โดยมี นายเผือก ช้างพลาย ครูใหญ่โรงเรียนประชาบาล ตำบลบางเก่า (บ้านบ่อไร่) มาเป็นรักษาการณ์ครูใหญ่ เปิดสอนชั้นเตรียมประถมศึกษาและชั้นประถมศึกษาปีที่ 1

      10 พฤษภาคม พ.ศ. 2490 ตำบลหนองขนาน มาสังกัดอำเภอเมืองเพชรบุรี จังหวัดเพชรบุรี (เดิมอยู่ในเขตอำเภอหนองจอก)

      พ.ศ. 2505 สร้างบ้านพักครู แบบกรมสามัญ(งบประมาณ 40,000 บาท)

      1 ตุลาคม พ.ศ. 2509 โรงเรียนเปลี่ยนสังกัดจากกระทรวงศึกษาธิการมาเป็นสังกัด องค์การบริการส่วนจังหวัด

      พ.ศ. 2496 ได้งบสร้างอาคารเรียนแบบ ป.1 จำนวน 2 ห้องเรียน งบประมาณ 30,000 บาท

      พ.ศ. 2515 ได้เงินจากสลากกินแบ่งรัฐบาลสร้างอาคารเรียนแบบ ป.1 ข จำนวน 6 ห้องเรียน งบประมาณ 239,000 บาท

      พ.ศ. 2519 เปิดสอนถึงชั้นประถมศึกษาปีที่ 5

      พ.ศ. 2520 เปิดสอนถึงชั้นประถมศึกษาปีที่ 6

      พ.ศ. 2521 ได้งบสร้างอาคารเรียน แบบ ป.1 ข  2 ห้องเรียน(เงินงบประมาณ 159,800 บาท)

      1 ตุลาคม 2523 โอนจากองค์การบริหารส่วนจังหวัดไปสังกัดสำนักงานคณะกรรมการการประถมศึกษาแห่งชาติ กระทรวงศึกษาธิการ

      พ.ศ. 2524 ได้งบ 49,000 บาท สร้างส้วมแบบกรมสามัญ 5 ที่นั่ง 1 หลัง (รื้อไปเมื่อ พ.ศ. 2537)

      พ.ศ. 2525 ได้งบ 188,000 บาท สร้างโรงฝึกงานแบบสามัญ 312 จำนวน 1 หลัง

      พ.ศ. 2527 ได้งบ 6,000 บาท ทำรางน้ำด้านหลังอาคาร ป.1 ข ทำถังน้ำแบบ ฝ.30 พิเศษ 4 ลูก งบ 30,000บาท ขุดสระน้ำ 4,500 บาท

      พ.ศ. 2528 ได้งบสร้างบ้านพักครู 35,000 บาท

      พ.ศ. 2529 ได้งบซ่อมอาคารเรียน ป.1 ข เปลี่ยนตัวอาคารฝั่งไม้เป็นก่ออิฐพร้อมทาสี เป็นจำนวนเงิน 39,000บาท ไม้ที่รื้อทำโต๊ะกินข้าวของนักเรียนได้ 10 ตัว ตั้งกองทุนเครื่องเขียนในรูปสวัสดิการของครู

      พ.ศ. 2530 ได้งบ 30,100 บาท ซ่อมเสาตอม่อและช่องลมอาคารเรียน ป. 1 ข.

      พ.ศ. 2531 สร้างเครื่องปั่นน้ำทำระบบประปาโรงเรียน 15,000 บาท ได้เงินสนับสนุนจาก นางทุเรียน สรรวิระยะ นางพรรณภา สืบสุคนธิ์ และ นายเทพ กลิ่นนิรัญ

      พ.ศ. 2523 สร้างห้องน้ำ- ส้วม 4 ห้อง ใช้เงินจากผู้ที่มาใช้สถานที่ กำนันสำรอง       วัดสว่าง 10,000บาท เงินกำไรจากสหกรณ์โรงเรียน 5,000 บาท รวม 32,750 บาท

      พ.ศ. 2534 ทำตู้เอกสาร 1.80*1.90 เมตร จำนวน 7 ตู้ในห้องเรียนและสหกรณ์โรงเรียนจำนวน 15,600 บาท

      พ.ศ. 2535 ทาสีภายนอกอาคารเรียน 3,780 บาท เงินจากผู้บริจาค

      พ.ศ. 2536 สร้างห้องน้ำ-ส้วม 1 หลัง 8 ที่นั่ง 65,000 บาทใช้เงินจากสหกรณ์โรงเรียน 5,000 บาท บริษัทกัลฟ์เฟอรีและคณะที่มาใช้สถานที่ร่วมบริจาค

      พ.ศ. 2537 สร้างรั้วไม้คอนกรีต รับเงินจากกลุ่มออมทรัพย์ 2,400 บาท ไม้ได้จากวัดสนามพราหมณ์ ทาสีภายในห้องเรียน 18,000 บาท ใช้เงินจากผู้บริจาค 27 กันยายน 2537   นายเกษม มีวาสนา หัวหน้าการ ส่งโรงเรียนเข้าประกวดโรงเรียนดีเด่นประจำจังหวัด ได้ที่ 3 กิจกรรมประชาธิปไตยได้ที่ 1 ของ สปอ.เมือง ได้รับรางวัลชมเชยจาก สปจ.

      7  กรกฎาคม พ.ศ. 2546 โอนการศึกษาจากสำนักงานคณะกรรมการการประถมศึกษาแห่งชาติ ไปเป็นสำนักงานเขตพื้นที่การศึกษาขั้นพื้นฐาน กระทรวงศึกษาธิการ

      พ.ศ. 2547 สร้างโรงอาหารใช้เงินจากผู้ใช้สถานที่ ผู้บริจาคเงินกองทุนเครื่องเขียนแบบเรียน 20,000 บาท และหลวงพ่อวัดหนองหว้า 10,000 บาท

      พ.ศ. 2548 สร้างรั้วซีแพคด้านหลังโรงเรียน 53,000บาท ใช้เงินจากงานวัดงานโรงเรียน ผู้มาใช้สถานที่ ผู้บริจาคและสหกรณ์โรงเรียน 5,000บาท

      พ.ศ. 2551 สร้างรั้วคอนกรีตด้านโรงเรียน นายชิษณุพงศ์ รินรดาทิตาวีร์ (นายบุญโชติ อัญขยม ชื่อเดิม) จัดหาเงิน 65,000 บาท ซ่อมห้องสมุดอาคารเรียน ซ่อมระบบน้ำของโรงเรียนทั้งหมดรวมเป็นเงิน 41,000 บาท นายชิษณุพงศ์ รินรดาทิตาวีร์ เป็นผู้หาเงิน ทำถนนลาดยางเข้าโรงเรียน มูลค่า 80,000 บาท

      พ.ศ. 2553 จัดสร้างระบบเรียนทางไกลและอินเตอร์เป็นเงิน 58,000บาท โดยนายชิษณุพงศ์ รินรดาทิตาวีร์ ผู้อำนวยการเป็นผู้รับเงินทั้งหมด

      พ.ศ. 2554 ติดเหล็กดัดประตู หน้าต่าง ช่องลม อาคารเรียน ติดมุ้งลวด ทาสีภายใน และนอก รวม 199,500 บาท เงินงบประมาณติดเหล็กดัด มุ้งลวด ทาสี ห้องสมุดเป็นเงิน 100,000 บาท รวมทั้งหมดเงินงบประมาณ 299,500 บาท

      พ.ศ. 2555 เปลี่ยนกระเบื้องหลังคาที่เสีย ทำฝ้าเพดาน 2 ห้องเรียน เปลี่ยนเสาและข้างฝาอาคารเรียนใช้เงินงบประมาณ 290,000 บาท

      13 มกราคม 2561 บริษัท อีซูซุ บริจาคสร้างห้องน้ำ 1 หลัง จำนวน 4 ห้อง ใช้เงิน 153,083 บาท ซ่อมแซมเวทีโรงอาหารใช้เงิน 40,000 บาท ซ่อมแซมสนามเด็กเล่น 34,010 บาท และจัดกิจกรรมร่วมกับนักเรียน รวมเป็นเงินทั้งสิ้น 230,000บาท

        12 กรกฎาคม พ.ศ.2562 นักศึกษาคณะสถาปัตยกรรม มหาวิทยาลัยศิลปากรกรุงเทพฯ ดำเนินการจัดสร้างห้องสมุดมอบให้โรงเรียน โดยทางนักศึกษาดำเนินการเองทั้งสิ้น

         พ.ศ. 2563 โรงเรียนได้รับงบประมาณปรับปรุงซ่อมแซมอาคารเรียน จากงบประมาณของ สพฐ โดยได้ปรับปรุงซ่อมแซมอาคารอเนกประสงค์ เป็นเงิน 321,100 บาท และอาคารเรียน ป1 ก 2 ห้องเรียนเป็นเงิน 371,500 บาท รวมทั้งหมดเป็นเงิน 692,600 บาท

         28 พฤศจิกายน พ.ศ. 2563 บริษัทโตเกียว เซซาชุโคะ สร้างลานธรรมะเจริญปัญญา เป็นเงิน 109,252 บาท

          ปัจจุบัน โรงเรียนเปิดทำการสอนตั้งแต่ระดับปฐมวัย – ระดับประถมศึกษาชั้นป.6