โรงเรียนวัดสรรเพชญ (ทวีวิทยาคม) เริ่มก่อตั้งและเปิดทำการสอนตั้งแต่ พ.ศ.2445 เป็นโรงเรียนแห่งแรกของอำเภอสามพราน (เดิมชื่ออำเภอตลาดใหม่) โดยพระครูทักษิณานุกิจ (ผัน) เจ้าอาวาสวัดสรรเพชญ ร่วมกับ พระเทวี ประชาชน นายอำเภอตลาดใหม่ เปิดสอนตั้งแต่ชั้นมูลจนถึงชั้นประโยค

พ.ศ.2450ทางอำเภอได้ตั้งเป็นโรงเรียนประจำอำเภอ เปิดสอนตั้งแต่ชั้นมูล จนึงชั้นมัธยมศึกษาปีที่ 3

9 กันยายน 2469 ประเทศไทยเกิดภาวะเศรษฐกิจตกต่ำขนาดหนัก จึงได้สั่งให้ยุบให้จัดการศึกษาตั้งแต่ชั้นมูลถึงชั้นประถมศึกษาปีที่ 4 ต่อมาได้สั่งปิดโรงเรียนเมื่อปี พ.ศ. 2473

25 พฤษภาคม 2475 พระครูถาวรวิทยา (เพิ่ม เพ็ญเพียร) ได้ก่อตั้งโรงเรียนขึ้นใหม่และเป้นครุใหญ่ทำการสอนและสร้างอาคารเรียนตั้งแต่ชั้นมูลถึงชั้นถาวรขึ้น

พ.ศ.2476 จัดการศึกษาประถมศึกษาปีที่ 6 โดยมีนายมานพ ณรงชวนะ เป็นครูใหญ่ ตั้งแต่ 25 พ.ค.  2476 -19 มิ.ย. 2478

พ.ศ.2478 ทางราชการได้ยุบการจัดการศึกษาให้เหลือแค่ชั้นประถมศึกษาปีที่4 ตาม พรบ.ประถมศึกษาในปี 2521

พ.ศ. 2542 โรงเรียนได้รับคัดเลือกจากสำนักงานคณะกรรมการการประถมศึกษาแห่งชาติ ให้เป็น โรงเรียนอนุบาลประจำอำเภอสามพราน

ปัจจุบัน โรงเรียนวัดสรรเพชญ (ทวีวิทยาคม) สังกัดสำนักงานเขตพื้นที่การศึกษาประถมศึกษานครปฐม เขต 2 กลุ่มโรงเรียนท่าจีนก้าวหน้า จัดการศึกษาระดับปฐมวัยและระดับประถมศึกษา 1 -6