พันธกิจของโรงเรียนบ้านคลองพระมอพิสัย มี 5 ประการ คือ

1.  จัดกระบวนการเรียนรู้ตามสาระหลักสูตร

2.  พัฒนากระบวนการเรียนการสอน โดยเน้นผู้เรียนเป็นสำคัญจากแหล่งเรียนรู้

3.  จัดกิจกรรมส่งเสริมและสอดแทรกคุณธรรม จริยธรรมในทุกกิจกรรรม

4.  จัดกิจกรรมส่งเสริมสุขภาพอนามัย

5.  พัฒนาสภาพแวดล้อมให้น่าอยู่ น่าเรียน ปลอดภัย

เป้าประสงค์ ของโรงเรียน

1.  นักเรียนมีความรู้ตามหลักสูตร

2.  นักเรียนได้รับโอกาสทางการศึกษาอย่างทั่วถึง

3.  นักเรียนมีคุณธรรมจริยธรรม และค่านิยมที่พึงประสงค์เป็นที่ยอมรับของชุมชน

4.  นักเรียนมีสุขภาพทางกายและทางจิตดี

5.  ผู้มีส่วนเกี่ยวข้องมีความพึงพอใจ

6.  นักเรียนจบการศึกษาในเวลาที่กำหนดและไม่ออกกลางคัน

7.  สถานศึกษามีระบบข้อมูลสารสนเทศที่สมบูรณ์ครบถ้วน

8.  ครูได้รับการนิเทศภายในอย่างเป็นระบบและต่อเนื่อง

9.   ชุมชนมีส่วนร่วมในการจัดการศึกษาและร่วมแลกเปลี่ยนเรียนรู้

10.  สถานศึกษาเป็นแหล่งบริการและแหล่งเรียนรู้ของชุมชน

11.  ครูและบุคลากรได้รับการพัฒนาอย่างต่อเนื่องเป็นครูมืออาชีพ

12.  คณะกรรมการสถานศึกษาได้รับการพัฒนา

13.  ครูและบุคลากรมีขวัญและกำลังใจ ได้รับค่าตอบแทนและสวัสดิการที่เหมาะสม

14.  มีระบบเทคโนโลยีที่ทันสมัยพอเพียง

15.  ชุมชนมีส่วนร่วมในการสนับสนุนทรัพยากร

16.  โรงเรียนได้รับการจัดสรรงบประมาณอย่างพอเพียง

17. มีการบริหารจัดการทรัพยากรที่มีคุณภาพ