โรงเรียนวัดลำพญา ฯ ที่ตั้งเลขที่ 77 หมู่ที่ 5 ตำบลลำพญา อำเภอบางเลน จังหวัดนครปฐม ซึ่งเป็นที่ธรณีสงฆ์ของวัดลำพญา จำนวน 15 ไร่ ระยะทางจากสำนักงานเขตพื้นที่การศึกษาประถมศึกษานครปฐม เขต 2 ประมาณ 25 กิโลเมตร
โรงเรียนวัดลำพญา ฯ เปิดเป็นโรงเรียนประชาบาลประเภทนายอำเภอจัดตั้ง เมื่อวันที่ 16 เมษายน พ.ศ. 2469 โดยใช้ศาลาการเปรียญวัดลำพญา เป็นสถานที่เล่าเรียน เปิดทำการสอนตั้งแต่ชั้นประถมศึกษา ปีที่ 1 ถึงชั้นประถมศึกษาปีที่ 4
พ.ศ. 2492 ทางราชการได้จัดสรรงบประมาณ ให้ทำการก่อสร้างอาคารเรียน เป็นเงิน 30,000 บาท พระครูสุวัตถิธรรมประภาส เจ้าอาวาสวัดลำพญา พร้อมทั้งกำนัน ผู้ใหญ่บ้านและคณะครู ได้รวบรวมเงินบริจาคจากผู้ปกครองนักเรียน และประชาชนชาวตำบลลำพญา สมทบเพื่อทำการก่อสร้างอาคารเรียนเป็นเงิน 71,123.90 บาท ทำการก่อสร้างอาคารเรียนแบบ ป.2 ซึ่งเป็นอาคารไม้ 2 ชั้น ขนาดกว้าง 9 เมตร ยาว 33 เมตร ขนาด 9 ห้องเรียน เสร็จเรียบร้อยใช้เป็นสถานที่เล่าเรียนตั้งแต่ปี พ.ศ. 2492
พ.ศ.2509 อาคารเรียนแบบ ป.2 ที่ก่อสร้างเมื่อ พ.ศ. 2492 ถูกลมพายุพัดพังเสียหายจนทางราชการ และประชาชนไม่สามารถทำการซ่อมแซมให้ใช้การได้ดังเดิมได้ จึงต้องกลับไปใช้ศาลาการเปรียญวัดลำพญา เป็นสถานที่เล่าเรียนดังเดิม
พ.ศ. 2509 กองสลากกินแบ่งรัฐบาลไทย ได้จัดสรรเงินงบประมาณทำการก่อสร้างอาคารเรียนแบบ 008 ของกรมสามัญศึกษา เป็นอาคารไม้ชั้นเดียวขนาดกว้าง 8.50 เมตร ยาว 90 เมตร จำนวน 10 ห้องเรียน เป็นเงิน 350,000 บาท โดยกำหนดให้มีพัสดุและครุภัณฑ์ พร้อมทั้งทำการทาสีด้วย คณะกรรมการศึกษา ซึ่งมีพระครูสุวัตถิธรรมประภาส เจ้าอาวาสวัดลำพญา เป็นประธาน พร้อมด้วยกำนัน ผู้ใหญ่บ้าน และคณะได้รวบรวมเงินบริจาคจากผู้ปกครองนักเรียน และประชาชนชาวตำบลลำพญาได้เงินบริจาค 180,000 บาท ทำการก่อสร้างอาคารเรียนดังกล่าวข้างต้นแล้วเสร็จในปีเดียว และใช้เป็นสถานที่เล่าเรียนตั้งแต่ปีการศึกษา 2510 และในปีการศึกษา 2510 ทางราชการได้อนุญาตให้โรงเรียนเปิดปิดเรียนประจำสัปดาห์จากเดิมปิดเรียนในวันโกนและวันพระ เป็นปิดเรียนในวันเสาร์และวันอาทิตย์
พ.ศ. 2510 คณะกรรมการศึกษาและคณะครู พิจารณาแล้วเห็นว่านักเรียนมีจำนวนเพิ่มขึ้น เพราะ จะต้องเปิดทำการสอนชั้นประถมปลาย ให้ครบชั้นเรียนจนถึงชั้นประถมศึกษาปีที่ 7 จึงได้ดำเนินการจัดทอดกฐินสามัคคีที่วัดลำพญา โดยมีวัตถุประสงค์เพื่อรวบรวมเงินบริจาค ทำการก่อสร้างอาคารเรียนประถมปลาย ได้เงิน 33,186.50 บาท ทำการก่อสร้างอาคารเรียนแบบ 008 หลังที่ 2 ได้ 1 ห้องเรียน นายสถิตย์ นางอุไร จรัญวงศ์ ได้บริจาคเงินจำนวน 40,000 บาท ทำการก่อสร้างต่อเติมอีก 1 ห้องเรียน รวมเป็น 2 ห้องเรียน
พ.ศ. 2511 คณะกรรมการศึกษาและคณะครู ได้จัดทอดกฐินสามัคคีเช่นปีที่ผ่านมา รวบรวมเงินบริจาคได้จำนวน 31,056 บาท ทำการก่อสร้างอาคารเรียนแบบ 008 หลังที่ 2 ได้อีก 1 ห้องเรียน
พ.ศ. 2512 ทางราชการได้อนุมัติเงินงบประมาณ ให้ทำการก่อสร้างต่อเติมอาคารเรียนแบบ 008 หลังที่ 2 อีก 3 ห้องเรียน เป็นเงิน 70,000 บาท โดยทางโรงเรียนได้หาเงินสมทบทำการก่อสร้างในครั้งนี้ เป็นเงิน 50,000 บาท พร้อมกันนี้พระครูสุวัตถิธรรมประภาส เจ้าอาวาสวัดลำพญา ได้บริจาคเงินส่วนตัว ทำการก่อสร้างห้องมุขกลางจำนวน 1 ห้องเรียน รวมอาคารเรียนหลังที่ 2 มีห้องเรียน 6 ห้องเรียน กับอีก 1 ห้องมุขกลาง
พ.ศ. 2519 ทางราชการได้จัดสรรเงินงบประมาณ ให้ทำการต่อเติมอาคารเรียนแบบ 008 หลังที่ 2 ให้ครบสมบูรณ์แบบ โดยให้ทำการต่อเติมห้องมุขทั้ง 2 ข้าง ออกไปอีก 2 ห้องเรียน เป็นเงิน 20,000 บาท รวมอาคารเรียนแบบ 008 หลังที่ 2 นี้มี 8 ห้องเรียน กับอีก 1 ห้องมุขกลาง ขนาดกว้าง 8.50 เมตร ยาว 72 เมตร นับเป็นอาคารเรียนหลังที่ 2
พ.ศ. 2529 ทางราชการได้อนุมัติให้โรงเรียนเปิดสอนชั้นอนุบาล 1 และเปิดชั้นอนุบาล 2 ในปีต่อมา จัดเป็นโรงเรียนที่เปิดสอนชั้นอนุบาลตามโครงการอนุบาลชนบท โดยโรงเรียนได้ใช้ห้องเรียนของศูนย์พัฒนาเด็กเล็กของตำบลลำพญา เป็นสถานที่เรียน และเก็บเงินบำรุงการศึกษาปีละ 100 บาทต่อคน
พ.ศ.2530 ทางราชการได้จัดสรรเงินงบประมาณ ให้ทำการซ่อมแซมอาคารเรียนแบบ 008 หลังที่ 1 และหลังที่ 2 เป็นเงิน 25,000 บาท โดยทำการซ่อมแซมพื้น ฝากั้นห้อง เปลี่ยนกระเบื้องมุงหลัง และซ่อมแซมบันได ที่ชำรุดให้สามารถใช้การได้ดีดังเดิม
พ.ศ. 2536 ทางราชการได้จัดสรรเงินงบประมาณทำการซ่อมแซมโรงฝึกงาน โดยให้ทำการเปลี่ยนจันทัน ชายรับน้ำ พื้น และกระเบื้องมุงหลังคาจำนวน 80 แผ่น
พ.ศ. 2537 ทางราชการได้จัดสรรเงินงบประมาณให้ทำการซ่อมแซมอาคารเรียนหลังที่ 1 และหลังที่ 2 และโรงฝึกงาน เป็นเงิน 100,300 บาท โดยทำการเปลี่ยนเสาตอม่ออาคารเรียนจำนวน 70 ต้น และเสาตอม่อ โรงฝึกงานจำนวน 12 ต้น
พ.ศ. 2539 ห้างหุ้นส่วนจำกัด ปึงหงี่เชียง โดยคุณเง็กลั้ง ญาโนภาส พระมหาสมศักดิ์ โทสญฺญู เจ้าอาวาสวัดลำพญา นายณรงค์ศักดิ์ เลิศสิทธิพันธ์ กำนันตำบลลำพญา และนายชัยวัตร แก้วคำหา อาจารย์ใหญ่โรงเรียนวัดลำพญา ฯ ได้ริเริ่มทำการก่อสร้างอาคารเรียนแบบ สปช.105/29 ขนาด 8 ห้องเรียน เพื่อเตรียมการไว้สำหรับโครงการขยายโอกาสทางการศึกษา ของกระทรวงศึกษาธิการ ที่จะให้ทุกโรงเรียน เปิดทำการสอน ภาคบังคับถึงชั้นมัธยมศึกษาปีที่ 3 และตั้งชื่ออาคารเรียนหลังนี้ว่า “อาคารกาญจนาภิเษก” เพื่อร่วมเฉลิมพระเกียรติ เนื่องในวโรกาสที่พระบาทสมเด็จพระเจ้าอยู่หัวทรงครองสิริราชสมบัติครบ 50 ปี โดย ได้ร่วมกันจัดงานชุมนุมศิษย์เก่าของโรงเรียนวัดลำพญาฯ ได้เงินจากการจัดงานและเงินบริจาคทำการก่อสร้างอาคารเรียนดังกล่าวข้างต้นเสร็จเรียบร้อย เป็นเงิน 2,808,500 บาท เมื่อทำการก่อสร้างเสร็จเรียบร้อยแล้วได้ทำพิธีเปิดป้ายอาคารเรียน “อาคารกาญจนาภิเษก” เมื่อวันที่ 5 เมษายน พ.ศ. 2540 เวลา 10.09 น. โดยทางคณะผู้ริเริ่มทำการก่อสร้าง ได้ขอประทานกราบเรียนเชิญ สมเด็จพระมหารัชมังคลาจารย์ เจ้าอาวาสวัดปากน้ำ เขตภาษีเจริญ กรุงเทพมหานคร เป็นประธานในพิธี และนายวิชัย ธรรมชอบ ผู้ว่าราชการจังหวัดนครปฐม เป็นผู้รับมอบในนามของสำนักงานคณะกรรมการการประถมศึกษาแห่งชาติ กระทรวงศึกษาธิการ
พ.ศ. 2540 นางถนอม อุบลนุช ได้บริจาคดินจำนวน 8,390 ลูกบาศก์เมตร ถมสนามโรงเรียนให้สูงจากเดิม 1.10 เมตร คิดเป็นเงิน 1,174,600 บาท
พ.ศ. 2541 สำนักงานการประถมศึกษาจังหวัดนครปฐม จัดสรรเงินงบประมาณทำการปรับปรุงระบบไฟฟ้าอาคารเรียนแบบ 008 หลังที่ 1 เป็นเงิน 48,900 บาท และพระมหาสมศักดิ์ โทสญญู เจ้าอาวาส วัดลำพญา ได้ทำการก่อสร้างถนน คสล. ขนาดกว้าง 3 เมตร ยาว 499 เมตร หนา 0.20 เมตร คิดเป็นเงิน 410,025 บาท
พ.ศ. 2543 สำนักงานการประถมศึกษาจังหวัดนครปฐม จัดสรรเงินงบประมาณทำการปรับปรุงระบบไฟฟ้าอาคารเรียนแบบ 008 หลังที่ 2 เป็นเงิน 71,800 บาท และนางปรียา สุขสมบัติ ได้บริจาคที่ดิน โฉนดเลขที่ 53135 เล่มที่ 532 หน้า 35 อำเภอบางเลน จังหวัดนครปฐม เนื้อที่ 1 งาน 54 ตารางวา ให้โรงเรียน ใช้ประโยชน์ คิดเป็นเงิน 154,000 บาท
วันที่ 1 ตุลาคม พ.ศ. 2509 รัฐบาลได้ออกพระราชบัญญัติโอนโรงเรียนประชาบาลทั้งหมดไปสังกัดองค์การบริหารส่วนจังหวัด จนถึงวันที่ 1 ตุลาคม พ.ศ. 2523 ได้ออกพระราชบัญญัติโอนโรงเรียนสังกัดองค์การบริหารส่วนจังหวัดทั้งหมด ไปสังกัดสำนักงานคณะกรรมการการประถมศึกษาแห่งชาติ กระทรวงศึกษาธิการ
วันที่ 7 กรกฎาคม พ.ศ. 2547 พระราชบัญญัติการศึกษา พ.ศ.2547 ได้โอนโรงเรียนสังกัดสำนักงานคณะกรรมการการประถมศึกษาแห่งชาติ ไปสังกัดสำนักงานคณะกรรมการการศึกษาขั้นพื้นฐาน โดยสังกัดสำนักงานเขตพื้นที่การศึกษาประถมศึกษานครปฐม เขต 2
พ.ศ. 2553 ได้สร้างส้วม แบบ อื่น ๆ จำนวน 6 ที่นั่ง 3 ที่ปัสสาวะ เป็นเงิน 180,000 บาท
พ.ศ. 2554 สร้างส้วม แบบ สพฐ. 4 จำนวน 4 ที่นั่ง 3 ที่ปัสสาวะ เป็นเงิน 352,000 บาท
ปัจจุบันโรงเรียนวัดลำพญา ฯ เปิดทำการสอนตามหลักสูตรประถมศึกษา พ.ศ. 2551 (ปรับปรุง พ.ศ. 2553) โดยเปิดทำการสอนตั้งแต่ชั้นอนุบาล 1 ถึงชั้นประถมศึกษาปีที่ 6 มีอาคารเรียนและอาคารประกอบ ดังนี้
1. อาคารเรียนจำนวน 1 หลัง แบบ สปช.105/29 จำนวน 8 ห้องเรียน
2. ส้วม 2 หลัง จำนวน 10 ที่นั่ง
3. โรงอาหารแบบอื่นๆ จำนวน 1 หลัง
รายนามผู้บริหารโรงเรียนวัดลำพญา (จำเนียรบำรุงวิทย์)
1. นายพรม ทองปรีชา พ.ศ 2469 – พ.ศ. 2470
2. นายเผื่อน ภู่รุ่งเรือง พ.ศ. 2470 – พ.ศ. 2486
3. นายอ่อง สังข์พญา พ.ศ. 2486 – 6 ก.ค. 10
4. นายสวั่น ติรกาญจนกุล 7 ก.ค. 10 – 31 มี.ค. 28
5. นางเพ็ญจันทร์ ภิรมย์ชุน 1 มิ.ย. 28 – 29 ธ.ค. 31
6. นายขวัญชัย โพธิ์ศรีทอง 5 ม.ค. 32 – 15 มี.ค. 39
7. นายชัยวัตร แก้วคำหา 1 พ.ค. 39 - 30 พ.ย. 52
9. นายศุภชาติ เกษมจิต 30 พ.ย. 52 - 4 ธ.ค. 55
10.นายสุทธิชัย ปุตตธรรมกุล 6 ธ.ค. 55 - 30 ต.ค. 59
11. นายสมมารถ ศิริสมพร ธ.ค. 59 - 4 พ.ย. 63
12. นายอดิศักดิ์ ดงสิงห์ 19 เม.ย. 64 - เม.ย. 66
13.นางวิชุตา ภควัฒนะ 16 ต.ุ.ค.66 - ปัจจุบัน