โรงเรียนบ้านไร่ฝายเปิดทำการสอนเมื่อ วันที่ 11 พฤษภาคม พ. ศ. 2504 เป็นโรงเรียนตามพระราชบัญญัติประถมศึกษา 2478
มีนายไร ตีเวิน เป็นผู้นำในการดำเนินงานก่อสร้างได้รับบริจาคที่ดินจำนวน 4 ไร่ 80 ตารางวาจาก นางเด็ด เจิมวงค์ และชาวบ้าน
ได้ช่วยกันสละทรัพย์รวมทั้งแรงกายปลูกสร้างอาคารเรียน 1 หลัง โดยมี นายเชย แดนเมือง เป็นครูใหญ่และครูผู้สอน
เปิดทำการสอนตั้งแต่ชั้นประถมศึกษาปีที่ 1 - ชั้นประถมศึกษาปีที่ 4 มีนักเรียนทั้งสิ้นจำนวน 62 คน โดยมีนายอำเภอชนแดน
ในสมัยนั้นมาเป็นผู้เปิด โรงเรียนต่อมาในปี พ. ศ. 2508 ได้มีนายเสนียน วันกิ่ง มาดำรงตำแหน่งครูใหญ่และได้เปิดเรียน
ตั้งแต่ชั้นเด็กเล็กจนถึงชั้นประถมศึกษาปีที่ 6 ในปี พ. ศ. 2527 เป็นต้นมา ต่อมาในปี พ. ศ. 2535 นายบรรจง สีที ได้มา
ดำรงตำแหน่งผู้บริหารโรงเรียนในตำแหน่งอาจารย์ใหญ่ เนื่องจากนายเสนียน วันกิ่ง เกษียณอายุราชการในปี พ.ศ. 2544
ได้เปิดทำการสอนชั้นอนุบาล1 - ชั้นมัธยมศึกษาปีที่ 3 โดยชั้นมัธยมศึกษาเป็นสาขาของโรงเรียนบ้านโนนตูม
จนถึงปีการศึกษา 2551 ภาคเรียนที่ 2 ได้ทำการปิดการจัดการเรียนการสอนระดับชั้นมัธยมศึกษา
ปัจจุบันโรงเรียนบ้านไร่ฝายเปิดสอนตั้งแต่ระดับชั้นอนุบาล 2 ถึงระดับชั้นประถมศึกษาปีที่ 6
โดยมีนายปณิธาน อุดนัน ผู้อำนวยการโรงเรียนบ้านไร่ฝาย