โรงเรียนบ้านหนองไคร้ เดิมชื่อโรงเรียนวัดศรีทรายมูล นายอุ้ย-นางสุคันธา ไคร้มูล ได้รับบริจาคเงินซื้ออุปกรณ์การเรียน 61.17 บาท เมื่อได้รับอนุญาตให้ตั้งโรงเรียนแล้วจึงเปิดทำการสอน เมื่อวันที่ 6 พฤศจิกายน พ.ศ 2471 ณ ศาลาบาตรวัดศรีทรายมูล โดยมีนายปัญญา ไคร้มูล เป็นครูใหญ่คนแรก

          ต่อมาได้ซื้อที่ดินจำนวนหนึ่งแปลงราคา 47 บาท ได้สร้างอาคารถาวร สร้างด้วยไม้ขึ้น 1 หลัง แต่ได้ ถูกพายุพัดเสียหาย เมื่อวันที่ 17 พฤษภาคม 2493  สิ้นค่าเสียหายประมาณ 1,154 บาท ต่อมาได้สร้างขึ้นอีกเป็นครั้งที่สองเมื่อวันที่ 1 มีนาคม พ.ศ. 2494 เสร็จเรียบร้อยแล้ว ปรากฏว่าอาคารเหล่านี้คับแคบมาก จึงได้สร้างศาลาขึ้น 1 หลัง หลังคามุงสังกะสี สิ้นค่าใช้จ่ายในการก่อสร้าง 48,472.25 บาท จัดให้มีการทำบุญฉลองเมื่อวันที่ 26 เมษายน 2498  ต่อมาในวันที่ 25 กรกฎาคม 2498 ได้ซื้อที่นาของ นายมา ไคร้โท้ง ขยายออกไปทางทิศตะวันออก เนื้อที่ 2 งาน 10 ตารางวา ราคา 1,000 บาท

          วันที่ 1 กันยายน พ.ศ. 2499 คณะกรรมการศึกษาของโรงเรียนได้ทำเรื่องขอเปลี่ยนชื่อจาก “โรงเรียนวัดศรีทรายมูล” มาเป็น“โรงเรียนบ้านหนองไคร้”

          วันที่ 4 มีนาคม พ.ศ. 2505 ได้ซื้อที่ดินเพิ่มเติมร่วมกับ สภาตำบลหนองจ๊อม หลังสถานีอนามัย  เนื้อที่ 2 งาน ราคา 1,000 บาทถ้วน และวันที่ 15 พฤษภาคม พ.ศ. 2508  โรงเรียนร่วมกับผู้ปกครองจัดหาเงินซื้อที่ดินด้านหลังสถานีอนามัยสมทบเพิ่มราคา 30,000 บาท โดยทำพิธีมอบ เมื่อวันที่ 26 กันยายน 2510 ต่อมาได้มีการสร้างรั้วโดยมีกรมชลประทานเชียงใหม่บริจาคอุปกรณ์ในการสร้าง

          ปี พ.ศ. 2516 ได้รับงบประมาณสร้างอาคารเรียนแบบ 017 ตึก 1 หลัง 4 ห้องเรียน งบประมาณ 270,000 บาท ทางโรงเรียนหาเงินสมทบอีก 30,000 บาท รวมเป็น 300,000 บาท และได้รับงบประมาณสร้างบ้านพักครูอีก 1 หลัง ตามแบบของกระทรวงศึกษาธิการ เป็นเงิน 45,000 บาท

          ปี พ.ศ. 2522 ได้งบประมาณให้สร้างอาคารเรียนแบบ 017 อีก 1 หลัง 4 ห้องเรียน เป็นเงิน   370,000 บาท  และได้ขออนุมัติรื้ออาคารเรียนไม้แบบ ป.2 หลังเก่า ซึ่งชำรุดทรุดโทรมมากและได้รื้อ เมื่อวันที่ 26 สิงหาคม 2522 นำไปสร้างเป็นห้องประชุมและห้องสมุด งบประมาณการก่อสร้าง 57,000 บาท  โดยไม่ใช้งบประมาณของทางราชการ

          เดือนมีนาคม 2531 ได้ต่อเติมอาคารเรียนชั้นล่างจำนวน 4 ห้องเรียนของอาคารพัฒนาศึกษา เป็นเงิน 120,000 บาท โดยไม่ใช้งบประมาณจากทางราชการ และได้รับงบประมาณ 40,000 บาท ขุดบ่อเลี้ยงปลา จำนวน 1 บ่อ

          ปีการศึกษา 2535 โรงเรียนบ้านหนองไคร้ ได้รับคัดเลือกให้เป็นโรงเรียนขยายโอกาสทางการศึกษาและเปิดทำการสอนชั้นมัธยมศึกษาปีที่ 1 โดยมี นายสงกรานต์ เดชปัญญา เป็นอาจารย์ใหญ่

          ปีงบประมาณ 2538 ได้รับงบประมาณก่อสร้างอาคารเรียนแบบ สปช.105/2529 จำนวน 1 หลัง ขนาด 6 ห้องเรียน งบประมาณ 1,778,819.27 บาท และในปีเดียวกันได้รับงบประมาณก่อสร้างสนามบาสเกตบอลอีก 1 สนาม งบประมาณ 128,000 บาท

          ปีงบประมาณ 2541 ได้รับงบประมาณต่อเติมอาคารเรียนแบบ สปช. 105/29 ขนาด 2 ห้องเรียน

          ปีงบประมาณ 2542 ได้รับงบประมาณก่อสร้างส้วมแบบ สปช. 601/26 จำนวน 1 หลัง 4 ที่นั่ง งบประมาณ 90,900 บาท

          ปีการศึกษา 2543  ทางราชการได้นำโรงเรียนบ้านสันป่าสักและโรงเรียนวัดแม่แก้ดหลวงมาเรียนร่วมที่โรงเรียนบ้านหนองไคร้ เนื่องจากมีจำนวนนักเรียนลดลง

          ปีงบประมาณ 2549 ได้รับงบประมาณจากองค์การบริหารส่วนตำบลหนองจ๊อม และผู้ปกครองนักเรียน ชุมชน ร่วมกันสร้างอาคารเรียน 1 หลัง ขนาด 3 ชิ้น 6 ห้อง งบประมาณทั้งสิ้น 5,000,000 บาท

          วันที่ 30 มีนาคม พ.ศ. 2553 โรงเรียนบ้านหนองไคร้ ได้ผ่านการประเมินให้เป็น ต้นแบบโรงเรียนในฝัน รุ่นที่ 2 (โรงเรียนดีใกล้บ้าน)

          ปีการศึกษา 2562 โรงเรียนบ้านหนองไคร้ได้รับคัดเลือกเข้าร่วมโครงการโรงเรียนคุณภาพประจำตำบล (1 ตำบล 1 รร.คุณภาพ) และโรงเรียนนำร่องนวัตกรรมการศึกษาจังหวัดเชียงใหม่

          ปัจจุบันมี   ปัจจุบันมี นายนพรัตน์  ปันเมา  ดำรงตำแหน่งผู้อำนวยการโรงเรียน  นางชนาภัทร  โมรีชาติ ดำรงตำแหน่งรองผู้อำนวยการโรงเรียนและนายปรีชา  ไชยวงศ์  ดำรงตำแหน่งรองผู้อำนวยการโรงเรียน