โรงเรียนบ้านแม่แต  ก่อตั้งเมื่อปี พ.ศ. 2480 โดยแยกจากโรงเรียนบ้านแม่แฝก ซึ่งมีนายอำเภอสันทรายเป็นผู้จัดตั้ง บนที่ดินของนายบุญส่ง สิโรรส เป็นผู้ที่ยกที่ดินให้จำนวน 2 ไร่ 1 งาน 26 ตารางวา และเปิดทำการสอนตั้งแต่ชั้นประถมศึกษาปีที่ 1 ถึงชั้นประถมศึกษาปีที่ 3  โดยมีนายศรีเนียม สุกันยา เป็นครูใหญ่คนแรก

          ในปี พ.ศ. 2497 โรงเรียนได้งบประมาณก่อสร้างอาคารเรียนแบบ ป.1 ตามแบบของกระทรวงศึกษาธิการ มีขนาดกว้าง 7เมตร ยาว 30 เมตร ซึ่งการก่อสร้างได้รับการสนับสนุนด้านแรงงานและทุนทรัพย์ สร้างเสร็จในปี พ.ศ. 2501 และได้เปลี่ยนชื่อโรงเรียนมาเป็นโรงเรียนบ้านแม่แต โดยมีนายพร้อม พรหมศรี เป็นครูใหญ่ และต่อมาก็ได้รับการสนับสนุนงบประมาณจำนวน 35,000 บาท ( สามหมื่นห้าพันบาทถ้วน ) สร้างอาคารเรียนไม่ 1 หลัง ขนาดกว้าง 9 เมตร ยาว 18เมตร  และต่อมาราษฎรและคณะกรรมการการศึกษาได้ร่วมกันบริจาคเงินจำนวน 1,750 บาท ( หนึ่งพันเจ็ดร้อยห้าสิบบาทถ้วน ) เพื่อซื้อที่ดินจำนวน 1 งานเศษมอบให้กับทางโรงเรียน และได้งบประมาณสร้างบ้านพักครูจำนวน1 หลัง

          ในปี พ.ศ. 2517 ได้งบประมาณสร้างอาคารเรียนเป็นตึกแถวชั้นเดียว แบบ ป. 1 ก. มีขนาดกว้าง 8.50เมตร ยาว 76 เมตร โดยใช้งบประมาณจากทางราชการ 170,000 บาท ( หนึ่งแสนเจ็ดหมื่นบาทถ้วน ) และงบประมาณจากราษฎรอีก 20,000บาท ( สองหมื่นบาทถ้วน ) สร้างเสร็จในปี พ.ศ. 2518 และในปี พ.ศ. 2521 เปิดทำการสอนชั้นประถมศึกษาปีที่ 5  และปี พ.ศ. 2522 เปิดทำการสอนชั้นประถมศึกษาปีที่ 6

          ในปี พ.ศ. 2526 ได้ทำบันทึกเสนอคณะกรรมการการประถมศึกษาอำเภอ เพื่อขอย้ายสถานที่ตั้งโรงเรียนจากที่เดิมมายังที่ตั้งของโรงเรียนปัจจุบัน ซึ่งราษฎรได้บริจาคที่ดินจำนวน 7 ไร่เศษ ให้กับทางโรงเรียน และได้รับงบประมาณสร้างอาคารเรียน อาคารประกอบดังนี้

          ปี พ.ศ. 2527 ได้จัดสร้างอาคารแบบเรียน สปช. 105/2526 จำนวน 1 หลัง 4 ห้องเรียน ใต้ถุนโล่ง ได้รับงบประมาณสร้างเรือนเพาะชำ แบบ พ.1 จำนวน 1 หลัง

          ปี พ.ศ. 2528 ได้รับงบประมาณ สร้างอาคารอเนกประสงค์แบบ 202/2526 จำนวน 1 หลัง

          ปี พ.ศ. 2529 ได้รับงบประมาณต่อเติมอาคารเรียนแบบ 105/2526จำนวน 1 หลัง 4 ห้องเรียน ได้รับ

                           งบประมาณสร้างส้วม 1 หลัง 4 ที่นั่ง

          ปีงบประมาณ 2553  ได้ย้ายบ้านพักครูมาสร้างใหม่ 1 หลัง

          ปีงบประมาณ 2560  ได้รับจัดสรรงบปรับปรุงซ่อมระบบไฟฟ้า-ประปา จำนวน 500,000  บาท

          ปีงบประมาณ 2561  ได้รับจัดสรรงบปรับปรุงซ่อมบ้านพักครู  (หลังที่ 1) จำนวน 179,400 บาท

          ปีงบประมาณ 2563  ได้รับจัดสรรงบปรับปรุงซ่อมแซมอาคารเรียน สปช.105/26 จำนวน 497,000 บาท