เดิมนักเรียนโรงเรียนบ้านวาน้อยได้ไปเข้าเรียนที่โรงเรียนบ้านวาใหญ่ สังกัดองค์การบริหารส่วนจังหวัดสกลนคร ซึ่งมีระยะทางประมาณ 1.5 กม. ในช่วงระหว่าง ปี พ.ศ. 2460-2497 โดยการเดิน ไป-กลับเช้าเย็น ราวปลายปี 2497 ผู้ใหญ่คำก้อน สุวรรณจันทร์ พร้อมราษฎร ได้ขอร้องให้ทางอำเภอซึ่งขณะนั้นขึ้นอยู่อำเภอวานรนิวาสเพราะอำเภออากาศเป็นตำบลขึ้นกับ อ.วานรนิวาส วางแผนการจัดตั้งโรงเรียนในปี พ.ศ.2497 นายอำเภอกระจ่าง บุญอาจ และนายชาญ พรหมพิทักษ์กุล ศึกษาธิการอำเภอวานรนิวาส จึงได้วางโครงการการจัดตั้งโรงเรียนนี้ขึ้น โดยราษฎรในหมู่บ้านนี้ได้จัดหาโต๊ะมานั่งจำนวน 21 ชุดโต๊ะเก้าอี้ครู 1 ชุด ตู้เก็บเอกสาร 1 หลัง นายอำเภอเเละศึกษาธิการอำเภอได้ทำพิธีเปิดบ้ายโรงเรียนโดยใช้ศาลาวัดไตรภูมิของหมู่บ้านเป็นสถานที่จัดกิจกรรมการเรียนการสอน มีนายทวี พรหมเทพ ดำรงตำแหน่งครูใหญ่คนแรก เมื่อวันที่ 11 กุมภาพันธ์ 2498 พร้อมกับย้าย นายทองใคร ชาเหลามาดำรงตำแหน่งครูผู้สอนอีกคนหนึ่ง รวม 2 คน
- วันที่ 7 กันยายน 2502 ได้ย้ายนายมนัส ยศรักษา มาดำรงตำแหน่งครูใหญ่ใหม่
- ปี พ.ศ. 2506 รัฐบาลได้ยกฐานะตำบลอากาศ เป็นกิ่งอำเภออากาศอำนวย และได้ย้ายนายมนัส ยศรักษา ไปเป็นเสมียนประจำแผนกศึกษาธิการอำเภอ โดยมอบหมายให้นายทองใคร ชาเหลา รักษาการแทน
- ปี พ.ศ. 2507 ได้รับงบประมาณในการก่อสร้างอาคารเรียนใหม่ โดยสร้างในพื้นที่โรงเรียน จำนวน 2-2-62 ไร่ ซึ่งอยู่ติดกับวัดไตรภูมิ งบฯจำนวน 25,000 บาท และชาวบ้านสมทบงบประมาณอีก จำนวน 25,000 บาท และก่อสร้างเสร็จเปิดทำการเรียนการสอนในปีเดียวกัน และนายมนัส ยศรักษาได้ย้ายกลับมาดำรงตำแหน่งครูใหญ่เหมือนเดิม
- ปี พ.ศ. 2511 นายพิกุล งวงคำนามได้ย้ายมาดำรงตำแหน่งครูใหญ่แทนนายมนัส ยศรักษา ที่ย้ายไปโรงเรียนบ้านเสาวัด
- ปี พ.ศ. 2517 นายทองใคร ชาเหลา ได้ย้ายไปดำรงตำแหน่งที่โรงเรียนบ้านวาใหญ่
ปัจจุบันโรงเรียนบ้านวาน้อย ตั้งอยู่ 210 หมู่ 3 ตำบลวาใหญ่ อำเภออากาศอำนวย จังหวัดสกลนคร 47170โทรศัพท์ 0-4279-9289 สังกัดสำนักงานเขตพื้นที่การศึกษาประถมศึกษาสกลนคร เขต 3 เปิดทำการสอนตั้งแต่ระดับก่อนประถมศึกษาถึงระดับประถมศึกษา มีเนื้อที่ 2-2-62 ไร่ โดยใช้พื้นที่วัดไตรภูมิ จำนวน 4 ไร่เศษ รวมทั้งสิ้น 6-2-62 ไร่