ก่อนตั้งโรงเรียนนี้นักเรียนไปเรียนที่โรงเรียนบ้านขี้เหล็ก ต่อมากระทรวงศึกษาธิการได้จัดตั้งโรงเรียนบ้านโคกสะอาดขึ้นใน พ.ศ. 2497 ซึ่งอยู่ทางทิศเหนือของบ้านหนองกกน้อยโดยประชาชนบริจาคทรัพย์สินและที่ดินก่อสร้าง ต่อมาใช้การไม่ได้จึงย้ายมาเรียนที่ศาลาวัดบ้านโคกสะอาด ใน พ.ศ. 2501 ทางราชการอนุมัติตั้งโรงเรียนบ้านหนองจาน ดังนั้นบ้านหนองจานจึงแยกไปเรียนเป็นเอกเทศ
พ.ศ. 2519 ได้รับงบประมาณก่อสร้างอาคารเรียนแบบ ป.1 ฉ เตี้ย จำนวน 6 ห้องเรียน สร้างบนที่ดินบริจาคของชาวบ้านบนทิศตะวันตกของหมู่บ้านบนเนื้อที่ 7 ไร่ 43 ตารางวา จนถึงปัจจุบันนี้
พ.ศ. 2522 ได้รับงบประมาณสร้างอาคารอเนกประสงค์ 1 หลัง
พ.ศ. 2525 ได้รับงบประมาณต่อเติมอาคาร ป.1 ฉ เตี้ย จำนวน 2 ห้องเรียน
พ.ศ. 2535 โรงเรียนได้รับงบประมาณสร้างอาคารเรียนแบบ สปช. 105/29 จำนวน 1 หลัง 6 ห้องเรียน งบประมาณก่อสร้าง 1,640,000 บาท