โรงเรียนวังทรายขาววิทยา แบ่งโครงสร้างการบริหารงานเป็น 4 ฝ่าย ได้แก่ ฝ่ายบริหารวิชาการ  ฝ่ายบริหารงบประมาณ ฝ่ายบริหารบุคคล และฝ่ายบริหารทั่วไป ผู้บริหารยึดหลักการบริหาร/เทคนิคการบริหารโดยใช้โรงเรียนเป็นฐาน ใช้หลักการบริหารแบบมีส่วนร่วม และยึดหลักการบริหารโดยใช้วงจรคุณภาพ PDCA