โรงรียนบ้านฮี เดิมเป็นโรงเรียนสาขาขึ้นกับโรงเรียนขุหลุ(ประชาสามัคคี) ตั้งขึ้นเมื่อ พ.ศ.2476 
เนื่องจากการเดินทางยากลำบากและจำนวนนักเรียนเพิ่มมากขึ้น 
จึงจัดตั้งเป็นโรงเรียนสาขาขึ้นที่ศาลาวัดศรีบุญเรือง ซึ่งเป็นวัดประจำหมู่บ้านฮี 
ต่อมาเมื่อวันที่  1  มิถุนายน พ.ศ. 2478 ทางราชการจึงแต่งตั้งให้เป็นโรงเรียนอิสระโดยใช้ชื่อว่า
โรงเรียนประชาบาลตำบลขุหลุ 2 (วัดบ้านฮี)
  เมื่อวันที่  1  มกราคม พ.ศ.2486  ชาวบ้าน ผู้นำชุมชนและครูได้ร่วมกันสร้างโรงเรียนขึ้นใหม่
ทางทิศใต้ของหมู่บ้านโดยใช้ที่ดินที่ชาวบ้านยกให้ และใช้ชื่อโรงเรียนประชาบาล ตำบลขุหลุ 2 (บ้านฮี)เหมือนเดิม 
ต่อมาเมื่อ พ.ศ. 2509  ทางราชการได้จัดสรรงบประมาณ  จำนวน  40000  บาท มาสร้างอาคารเรียนหลังใหม่
โดยได้ปลูกสร้างบนพื้นที่ดินสาธารณะดอนเจ้าปู่ ที่ชาวบ้านมอบให้  ซึ่งอยู่ทางทิศตะวันออกของหมู่บ้าน
และได้ย้ายนักเรียนมาเรียนที่อาคารหลังใหม่เมื่อวันที่ 2 มกราคม พ.ศ.2510
และได้เปลี่ยนชื่อเป็น "โรงเรียนบ้านฮี" ตั้งแต่นั้นเป็นต้นมา