โรงเรียนบ้านเมืองจันทร์ ตั้งอยู่บ้านเมืองจันทร์ หมู่ที่ 2 ตำบลเมืองจันทร์ อำเภอเมืองจันทร์ จังหวัดศรีสะเกษ ก่อตั้งเมื่อวันที่ 16 มกราคม 2466 เดิมใช้ศาลาวัดเมืองจันทร์ เป็นสถานที่จัดการเรียนการสอน เปิดสอนชั้น ป.1-ป.4 ชุมชนใช้ภาษาถิ่น(ส่วย)ในการติดต่อสื่อสารกัน มีโบราณสถานที่สำคัญ คือ ธาตุเมืองจันทร์ ซึ่งตั้งอยู่ภายในบริเวณวัด อยู่ห่างจากโรงเรียนทางด้านทิศตะวันตกประมาณ 100 เมตร
ปี พ.ศ.2487 ได้ย้ายโรงเรียนจากศาลาวัด มาตั้งเป็นเอกเทศ ณ ที่ตั้งปัจจุบัน ซึ่งอยู่ทางทิศตะวันออกของวัดเมืองจันทร์ บนเนื้อที่ 13 ไร่ 3 งาน 09 ตารางวา
ปี พ.ศ.2518 ได้เปิดขยายชั้นเรียน และเปิดสอนชั้น ป.1-ป.7
ปี พ.ศ.2521 เปิดทำการสอนตามหลักสูตรพุทธศักราช พ.ศ.2521 ชั้น ป.1-ป.6 ตามลำดับและได้รับการอนุมัติให้เปิดสอนชั้นเด็กเล็ก (เด็กที่มีปัญหาทางภาษา)
ปี พ.ศ.2540 เป็นโรงเรียนในโครงการปฏิรูปการศึกษา มีห้องปฏิบัติการพิเศษ 3 ห้อง คือห้องปฏิบัติการทางวิทยาศาสตร์ ห้องปฏิบัติการคอมพิวเตอร์และห้องปฏิบัติการทางภาษา
ปี พ.ศ.2542 เป็นโรงเรียนเครือข่ายวิทยาการ
ปี พ.ศ.2544 เป็นโรงเรียน 1 โรงเรียน 1 คุณภาพของตำบลเมืองจันทร์
ปี พ.ศ. 2552 ได้รับรางวัลสถานศึกษาพอเพียง
ปี พ.ศ. 2553 ได้รับรางวัลโรงเรียนส่งเสริมสุขภาพ
ปี พ.ศ. 2554 ได้เข้าร่วมโรงเรียนดีประจำตำบลรุ่น 2
ปี พ.ศ. 2555 ได้รับรางวัลโรงเรียนส่งเสริมทันตกรรมระดับชาติ
และบ้านวิทยาศาสตร์น้อย
ปี พ.ศ.2560 โรงเรียนปลอดขยะ Zero Wates School
ปี พ.ศ.2562 ได้รับรางวัลโรงเรียนศีล 5 ตามรอยพ่ออย่างพอเพียง ระดับเพชร
ปัจจุบันเปิดทำการสอน 2 ระดับ คือ ระดับก่อนประถมศึกษาและระดับประถมศึกษา ชั้นอนุบาล 2 ถึงชั้นประถมศึกษาปีที่ 6