โรงเรียนบ้านตาทองตั้งขึ้นเมื่อปีพ.ศ.2483 ที่บ้านตาทอง หมู่ที่ 8 ตาบลผักไหม อำเภออุทุมพรพิสัย
จังหวัดศรีสะเกษ โดยนายอำเภอเป็นผู้ดำเนินการก่อสร้าง เปิดทำการสอนตั้งแต่ชั้นประถมศึกษาปีที่1 ถึงชั้นประถมศึกษาปีที่ 4 มีนายเขื่อง พิลัย เป็นครูใหญ่คนแรก นายผุย ตาทอง เป็นผู้บริจาคที่ดินให้ก่อสร้างโรงเรียนวันที่ 14 เดือน กุมภาพันธ์ พ.ศ.2497 ได้ย้ายสถานที่เรียนไปที่ศาลาวัดบ้านผักไหมน้อยเนื่องจากอาคารเรียนทรุดโทรมมากขาดงบประมาณซ่อมแซม ที่ดินของโรงเรียนที่บ้านตาทองปัจจุบันได้ขุดสระน้าสาธารณประโยชน์ เมื่อปี พ.ศ. 2528ปี พ.ศ. 2501 คณะครู กำนันและผู้ใหญ่บ้าน กรรมการศึกษา ได้พร้อมใจกันสร้างอาคารเรียนเป็นเอกเทศขึ้นในที่ดินมีผู้บริจาคให้ เนื้อที่ 13 ไร่ - งาน 0.86 ตารางวา อยู่ด้านทิศตะวันตกของบ้านดู่หมู่ที่ 3 ตำบลผักไหม อาเภออุทุมพรพิสัย
จังหวัดศรีสะเกษ เมื่อสร้างเสร็จคณะกรรมการศึกษาประชาชนและคณะครู มีมติให้ย้ายโรงเรียนวัดบ้านผักไหมใหญ่และโรงเรียนบ้านตาทองมาเรียนด้วยกัน ที่โรงเรียนเอกเทศที่สร้างขึ้นใหม่ โดยการขออนุญาตยุบโรงเรียนวัดบ้านผักไหมใหญ่รวมเข้ากับโรงเรียนบ้านตาทอง ชื่อโรงเรียนยังใช้ชื่อว่า “โรงเรียนบ้านตาทอง”ปัจจุบันโรงเรียนบ้านตาทอง ตั้งอยู่หมู่ที่ 3 ตาบลผักไหม อาเภอห้วยทับทัน จังหวัดศรีสะเกษรหัสไปรษณีย์ 33210 สังกัดสานักงานเขตพื้นที่การศึกษาประถมศึกษาศรีสะเกษ เขต 2 สานักงานคณะกรรมการการศึกษาขั้นพื้นฐาน กระทรวงศึกษาธิการ
ระดับการศึกษาที่สอน ชั้นอนุบาล 1 – ชั้นประถมศึกษาปีที่ 6