โรงเรียนบ้านหอย ตั้งเมื่อวันที่ 1 มิถุนายน 2483 ที่บ้านหอย หมู่ที่ 10 ต.หัวช้าง อ.อุทุมพรพิสัย จ.ศรีสะเกษ ด้วยความร่วมมือร่วมใจของชาวบ้าน โดยมี นายปัญญา แก้วปัญญา บริจาคที่ดิน จำนวน 5 ไร่ โรงเรียนดำรงอยู่ได้ด้วยเงินบำรุงการศึกษา ของทางราชการ และชุมชน ครูใหญ่คนแรกชื่อ นายสูรย์ ไชยชนะ ผู้ปกครองและชุมชนได้ช่วยกันปลูกสร้างอาคารเรียนหลังแรก ซึ่งทางราชการให้งบประมาณสมทบการก่อสร้าง จำนวน 25,000 บาท
ต่อมาทางราชการแต่งตั้ง นายเลียน ศรีเลิศ มาดำรงตำแหน่งครูใหญ่ และได้นำชาวบ้านพัฒนาโรงเรียนมาเรื่อยๆตามลำดับ
จนถึง นายพิมพ์ แก่นจันทร์ ดำรงตำแหน่งครูใหญ่ ได้รับงบประมาณจากทางราชการ จำนวน 5,000 บาท และชาวบ้านบริจาค ปลูกสร้างต่อเติมอาคารเรียนแบบ ป.1ซ จำนวน 1 หลัง
นายหนูพูน บึงไกร ได้ดำรงตำแหน่งครูใหญ่คนต่อมา ได้ปรับปรุงโรงเรียน และสร้างเสาธง ซุ้มประตู ขุดเจาะน้ำบาดาล โดยได้รับเงินบริจาคจากชาวบ้าน และได้เปิดขยายชั้นเรียนจนถึง ชั้นประถมศึกษาปีที่ 6 ทางราชการให้งบประมาณสร้างอาคารเรียนแบบ ศก. 04 ก. จำนวน 1 หลัง บ้านพักครู จำนวน 1 หลัง ส้วม 1 หลัง อาคารอเนกประสงค์ จำนวน 1 หลัง
ต่อมา นายพิจิตร รักษาพันธ์ มาดำรงตำแหน่งครูใหญ่ ได้นำชาวบ้านปรับปรุงซ่อมแซม และต่อเติมเชื่อมอาคารเรียนทั้ง 2 หลัง สร้างสวนธรรมะ 1 แห่ง
วันที่ 8 สิงหาคม 2533 ทางราชการได้แต่งตั้ง นายสมปอง รินทอง มาดำรงตำแหน่งครูใหญ่ และปรับปรุงตำแหน่งเป็นอาจารย์ใหญ่ โดยได้นำคณะครูและชาวบ้านพัฒนาโรงเรียนดีขึ้นเรื่อยๆมา
วันที่ 15 กรกฎาคม 2542 นายสถิตย์ ศรีสุรักษ์ ได้รับการแต่งตั้งให้มาดำรงตำแหน่งอาจารย์ใหญ่ และได้ปรับปรุงตำแหน่งเป็นผู้อำนวยการโรงเรียนต่อมา
วันที่ 7 เมษายน 2547 บริษัทรอยัล คิงส์ โดยนายอนันต์ สัจเดย์ ประธานกรรมการบริหารได้ก่อสร้างอาคารเรียน แบบ สปช.102/26 จำนวน 1 หลัง และส้วม แบบ สปช. 601/29 จำนวน 2 ที่นั่ง มูลค่ารวม 720,000 บาท
วันที่ 26 มกราคม 2550 สำนักงานเขตพื้นที่การศึกษาประถมศึกษาได้บรรจุแต่งตั้งนายประทีป เพ็งแจ่ม มาดรงตำแหน่งผู้อำนวย
โรงเรียนบ้านหอย ได้รับความร่วมมือร่วมใจจากคณะครู กรรมการศึกษาขั้นพื้นฐาน ผู้ปกครองนักเรียน ชุมชน และหน่วยงานที่เกี่ยวข้อง พัฒนาขึ้นตามลำดับ จนมีผลงานที่น่าภาคภูมิใจมากมาย มาจนถึงทุกวันนี้