โรงเรียนบ้านโพนทรายโนนเรือ  ตั้งขึ้นครั้งแรกเมื่อวันที่  1  กันยายน  2479   ที่ตั้งอยู่ภายในวัดบ้านโพนทราย  โดยอาศัยศาลาวัดบ้านโพนทราย  เป็นสถานที่ศึกษาเล่าเรียนใช้ชื่อว่า  “โรงเรียนประชาบาลวัดบ้านโพนทราย”  เปิดทำการสอนจากชั้น  ป.1 ถึงชั้น  ป.4  มีนักเรียนจาก  3  หมู่บ้าน เข้าเรียนร่วมกันคือ  บ้านโนนเรือ  หมู่ที่  2   ตำบลหนองบัว  บ้านโพนทราย   หมู่ที่  3  ตำบลหนองบัวและบ้านสิม  หมู่ที่  7  ตำบลดูน

           ต่อมาเมื่อปี  พ.ศ. 2500  นักเรียนบ้านสิมได้แยกไปเรียนที่ศาลาวัดบ้านสิม  คงเหลือนักเรียนจาก  2  หมู่บ้าน  อาศัยศาลาวัดบ้านโพนทรายเป็นสถานที่ศึกษาเล่าเรียนเรื่อยมาเป็นเวลา  40  ปี

            เมื่อวันที่ 1   ตุลาคม  2516  ทางราชการมีนโยบายที่จะเอาโรงเรียนออกจากวัดให้หมดสิ้น  คณะกรรมการซึ่งประกอบด้วยนายคำ  สังวาล  ผู้ใหญ่บ้านโพนทราย  นายสูรย์   พวงจำปา  ผู้ใหญ่บ้านโนนเรือ  เจ้าอาวาสวัดบ้านโพนทราย  คณะกรรมการศึกษา  และผู้ทรงคุณวุฒิได้ประชุมปรึกษาหารือกันจัดหาที่ดินสำหรับปลูกสร้างอาคารเรียนเอกเทศถาวร

           ทั้งนี้นายคำ  สังวาลย์  พร้อมนางเล็ก  สังวาลย์  ผู้ใหญ่บ้านโพนทรายและภรรยา  ได้เสนอ  มอบที่ดิน  1  แปลง  ซึ่งเป็นทรัพย์สินมรดกฝ่ายนางเล็ก  สังวาล  ให้เป็นที่ปลูกสร้างอาคารเรียนเอกเทศถาวร  ซึ่งที่ดินดังกล่าวมีเขตติดต่อดังนี้

                      ทิศเหนือ  ติดถนนสาธารณะ  สายอำเภอกันทรารมย์ไปตำบลหนองบัว

                      ทิศใต้       ติดเขตที่วัดบ้านโพนทราย

                      ทิศตะวันตก   ติดกับถนนเข้าสู่หมู่บ้านโพนทราย

                      ทิศตะวันออก      ติดกับที่ดินของนายคำ – นางเล็ก  สังวาล  และที่ธรณีสงฆ์  เนื้อที่ทั้งหมด  3  ไร่  1  งาน  55.3   ตารางวา  (รังวัดโดยทางราชการ  ปี  พ.ศ. 2540 )  มูลค่าประมาณ  60,000  บาท                   ที่ประชุมมีมติเห็นชอบ นายคำ – นางเล็ก  สังวาลย์  ได้ยกมอบที่ดินแปลงนี้ให้แก่ทางราชการโดยไม่คิดมูลค่าแต่ประการใด  ต่อมาคณะครู  ผู้ใหญ่บ้าน  กรรมการศึกษา  ผู้ปกครองนักเรียนได้ร่วมกันถางป่า  ปราบพื้นที่และปรับปรุงบริเวณ  โดยขอความร่วมมือจากหน่วยงาน  ร.พ.ช.  ศรีสะเกษ  นำเครื่องจักรกลมาช่วยดำเนินการ  จนพื้นที่ราบเตียนพอที่จะใช้ในการปลูกสร้างอาคารแบบ  ศก.01  ขนาด  1  ชั้น  3  ห้องเรียน  เป็นเงิน  180,000    บาท   การก่อสร้างแล้วเสร็จเมื่อวันที่  10  มกราคม   2520  และได้ทำพิธีเปิดอาคารเรียนใหม่  ย้ายนักเรียนจากศาลาวัดบ้านโพนทรายมาอาศัยเรียนที่อาคารเรียนหลังนี้  ตั้งแต่วันที่  15  มกราคม  2520  มีนายภู  พิทักษา   นายอำเภอกันทรารมย์  เป็นประธานในพิธี

              ปีงบประมาณ   2524   ได้รับงบประมาณปลูกสร้างโรงฝึกงาน ศก.23  เป็นเงิน  53,000 บาท

               ปีงบประมาณ   2527   ได้รับงบประมาณก่อสร้างต่อเติมอาคารเรียนด้านข้าง  2  ชั้น  1                  ห้องเรียน (ล่าง 1 ห้อง บน 1 ห้อง)  ใช้งบประมาณ   190,000  บาท  แล้วเสร็จเมื่อวันที่  17  กันยายน  2527

               ปีงบประมาณ  2527    ได้รับงบประมาณก่อสร้างส้วมขนาด  4  ที่  เป็นเงิน  38,000   บาท                          สร้างแล้วเสร็จวันที่  15  ตุลาคม  2527

              ปี  พ.ศ. 2532  คณะศิษย์เก่าและครูอาจารย์ได้จัดทำผ้าป่าสามัคคี  หาทุนมอบให้โรงเรียนสร้างห้องสมุดเป็นเอกเทศชั้นเดียว  จำนวนเงิน   85,000  บาท

              ปี  พ.ศ. 2533  ต่อเติมห้องสมุดอีก 1 ห้อง เป็นเงิน 25,000  บาท  และได้เชิญ  นายรังสรรค์  บัวจูม  หัวหน้าการประถมศึกษาอำเภอกันทรารมย์มารับมอบเป็นทางการ และได้รับงบประมารณสร้างส้วมแบบ สปช. 601/26  จำนวน  2  ที่

              ปี  พ.ศ.2534  มูลนิธิ  ได้บริจาคเงินจำนวน  8,800  บาท  เพื่อจัดซื้อคุรุภัณฑ์ห้องสมุดโรงเรียน

              ปี  พ.ศ.2535  คณะผ้าป่าผู้มีจิตศรัทธาจากกรุงเทพ ฯ  มอบเงินเป็นทุนในการปรับปรุงสนามโรงเรียนเป็นเงิน  46,490   บาท  และนายถวิล  ชาวศรี จากจังหวัดนนทบุรี  มอบพระพุทธรูปปางลีลา  เพื่อประดิษฐานหน้าอาคารเรียน  1  องค์ และพระบรมรูปรัชกาลที่  5  ประทับยืน  1  องค์  มูลค่า  33,990  บาท

             ปี  พ.ศ. 2536  คณะศิษย์เก่า  กรรมการศึกษาวัด ตลอดทั้งผู้ปกครองนักเรียน สนับสนุนเงินสร้างรั้วคอนกรีต  ความยาว  140  เมตร  มูลค่า  60,000  บาท

             สถาบันเทคโนโลยีพระจอมเกล้าพระนครเหนือร่วมกับชุมชน  สร้างอาคารอนุบาล  1  ห้องเรียน งบประมาณ   100,000  บาท

             ปี  พ.ศ. 2540  จัดทำโรงเรียนให้เป็นปัจจุบันตามโครงการปฏิรูปการศึกษา ทาสีอาคารเรียน ศ.ก. 23  เทคอนกรีตพื้นอาคารเรียนชั้นล่าง  4  ห้อง  เทคอนกรีตอาคารอเนกประสงค์ งบประมาณต้นสังกัด  80,000 บาท  ชุมชนบริจาคมูลค่า  20,000  บาท

            ปรับปรุงห้องเป็นห้องปฏิบัติการทางภาษาตามโครงการปฏิรูปการศึกษา จำนวน  1  ห้องเรียน งบประมาณต้นสังกัด   39,952   บาท

            สร้างสนามวอลเลย์บอล  โดยการบริจาคของคณะศิษย์เก่างบประมาณ  40,000  บาท

            ปี  พ.ศ. 2548  คณะครูและผู้ปกครองนักเรียน สนับสนุนเงินสร้างรั้วคอนกรีต  ความยาว  55  เมตร มูลค่า   45,000    บาท

            เดือน   กุมภาพันธ์    พ.ศ. 2549   นักศึกษาคณะรัฐประศาสนาศาสตร์  4.10/2548   มหาวิทยาลัยราชภัฎอุบลราชธานี   ได้ออกค่ายอาสาพัฒนาจัดสร้างศาลาพักผ่อนของนักเรียน  มูลค่า  30,000   บาท

            ปี พ.ศ. 2553   ซื้อที่ดินเพิ่มเติมจำนวน  2  งานและปรับสภาพของพื้นดินให้เหมาะสมสำหรับการใช้สอยและได้รับงบประมาณจากทางราชการในการสร้างรั้วโรงเรียนจำนวนเงิน  200,000  บาท

           ปี พ.ศ. 2553  จัดสร้างรั้วโรงเรียนจากงบฯแปรญัติติ   จำนวน     200,000  บาท

           ปี พ.ศ. 2554  ได้จัดสร้างถนนคอนครีตภายในโรงเรียนจากงบฯแปรญัติติ จำนวน   100,000  บาท

           ปี พ.ศ. 2555  จัดสร้างระบบประปาในโรงเรียน ซึ่งสนับสนุนโดยบริษัทกรุงเทพฯประกันชีวิต(มหาชน)       จำนวน     38,890      บาท  

           ปี พ.ศ. 2555  จัดสร้างอาคารเรียนระดับอนุบาล จำนวน  2  ห้อง  มูลค่า  500,000  บาท  สนับสนุนโดยพระครูสุวรรณธรรมวิบูล  คณะครู ผู้ปกครองและประชาชนในเขตบริการทั้ง 2 หมู่บ้าน

           ปี พ.ศ. 2555  จัดสร้างซุ้มประตูโรงเรียน มูลค่า  40,000   บาท  สนับสนุนโดยพระครูสุวรรณธรรมวิบูล  นายทองคำ –  นางสมมิตร  ศรีโพธิ์

          ปี พ.ศ. 2558 ได้รับจัดสรรงบประมาณปรับปรุงซ่อมแซมอาคารเรียนอาคารประกอบ จำนวน 1,273,000 บาท

          ปี พ.ศ. 2559 ได้รับจัดสรรงบประมาณปรับปรุงซ่อมแซมและขยายเขตระบบไฟฟ้าภายในโรงเรียนงบประมาณ 465,280 บาท

          ปี พ.ศ. 2560 ได้รับจัดสรรงบประมาณโครงการส่งเสริมผลผลิตเพื่ออาหารนักเรียนในโรงเรียนประถมศึกษา ปี 2560 กิจกรรมเลี้ยงไก่พันธุ์ไข่ โดยก่อสร้างโรงเรือนเลี้ยงไก่ด้วยงบประมาณ 45,000 บาท

          ปี พ.ศ. 2562 ได้รับจัดสรรงบประมาณ ปีงบประมาณ 2562 จาก สพฐ. ก่อสร้างอาคารเรียน สปช.105/29 ปรับปรุง 2 ชั้น 4 ห้องเรียน(ชั้นล่างโล่ง) งบประมาณ 2,970,000 บาท

          ปี พ.ศ. 2563  ก่อสร้างห้องน้ำ(อาคารเรียนหลังใหม่) โดยระดมทรัพยากรจากกิจกรรมผ้าป่าเพื่อการศึกษา งบประมาณ 350,000 บาท

          ปี พ.ศ. 2563  ได้รับจัดสรรงบประมาณ ปีงบประมาณ 2563 งบลงทุน ค่าครุภัณฑ์ประจำห้องสมุด งบประมาณ 343,600 บาท