โรงเรียนบ้านหนองผือ ได้รับอนุมัติให้จัดตั้งเมื่อวันที่ ๗ เดือน พฤษภาคม พ.ศ. ๒๕๐๑ ที่หมู่บ้านหนองผือ โดยมีผู้บริหารคนแรกชื่อนายแววจักร ธรรมสุข และนางสาวสมบูรณ์ พุทธานุ เป็นครูผู้สอน เปิดทำการสอน ตั้งแต่ ชั้น ป.๑ – ป.๔ แรกเปิด มีนักเรียน ๗๘ คน เป็นชาย ๓๒ คน เป็นหญิง ๔๖ คน แรกตั้ง ได้อาศัยศาลากลางบ้าน เป็นที่อาศัยเรียนไปพลางก่อน
ในวันที่ ๑ มิถุนายน ๒๕๐๕ ได้สร้างอาคารเรียนขึ้นใหม่ เป็นแบบ ๐๐๑ ขนาดกว้าง ๖ ยาว ๑๕ เมตร ในที่ดินของโรงเรียน เมื่อสร้างเสร็จแล้ว เป็นอาคารชั่วคราว จึงขออนุญาตทางราชการ ย้ายจากโรงเรียนหลังเก่า มาเรียนที่ใหม่ เมื่อวันที่ ๒๔ มกราคม พ.ศ. ๒๕๐๖ ในปี ๒๕๑๐ นางสมบูรณ์ พุทธานุ ย้ายไปดำรงตำแหน่งครูโรงเรียนบ้านหนองผือ นางสาวทองแสน แสงทอง ครูโรงเรียนบ้านซาต ย้ายมาดำรงตำแหน่งแทน
ต่อมาวันที่ ๒๔ สิงหาคม ๒๕๑๕ นายแววจักร ธรรมสุข ครูใหญ่ โรงเรียนบ้านหนองผือ ย้ายไปดำรงตำแหน่งครู โรงเรียนบ้านหนองผือ และแต่งตั้งนายสนั่น แสนเสริม ครูตรี โรงเรียนบ้านโนนสั้น มาดำรงตำแหน่งครูใหญ่ตรี โรงเรียนบ้านหนองผือ ตั้งแต่วันที่ ๒๕ สิงหาคม ๒๕๑๕
ในปีงบประมาณ ๒๕๑๗ ทางราชการ ได้อนุมัติเงิน จำนวน ๑๒๗,๐๐ บาท ราษฎรสมทบอีกจำนวน ๗,๕๐๐ บาท รวมเป็นเงิน ๑๓๔,๕๐๐ บาท ปลูกสร้างอาคารเรียนถาวรแบบ ป,1ฉ ขนาด ๓ ห้องเรียน กว้าง ๘.๕๐ เมตร ยาว ๒๗ เมตร เสร็จเมื่อวันที่ ๑๗ กรกฎาคม ๒๕๑๗
ในปีงบประมาณ ๒๕๒๕ สปช. ได้อนุมัติงบประมาณ ๔๕๐,๐๐๐ บาท สร้างอาคารอีกหลังหนึ่งเมื่อวันที่ ๘ ธันวาคม ๒๕๒๕ เป็นอาคารแบบ ป.๑ ฉ สูง จำนวน ๓ ห้องเรียน กว้าง ๘.๕๐ เมตร ยาว ๒๗ เมตร สร้างเสร็จเมื่อวันที่ ๖ เดือนกุมภาพันธ์ ๒๕๒๖ ในปีงบประมาณเดียวกันนี้ได้งบสร้างส้วม แบบ สปช.๖๐๑/๒๕๒๖ ขนาด ๔ ที่
ในปี พ.ศ. ๒๕๒๗ คณะครู ผู้ใหญ่บ้าน กรรมการศึกษา และผู้ปกครองนักเรียน ตลอดจน ผู้มีจิตศรัทธา ได้รับบริจาคเงิน จำนวน ๒๐,๐๐๐ บาท ซื้อที่ดินด้านตะวันออกของโรงเรียน เนื้อที่ประมาณ ๑ ไร่ ๒ งาน ให้โรงเรียนบ้านหนองผือ มีเนื้อที่ทั้งหมด ๕ ไร่ ๙๓ ตารางวา
ในปี พ.ศ. ๒๕๒๘ สปช. ได้อนุมัติงบประมาณ สร้างอาคารอเนกประสงค์ แบบ สปช. ๒๐๒/๒๕๒๖ กว้าง ๑๐ เมตร ยาว ๑๒ เมตร พื้นที่ ๑๒๐ ตารางเมตร เสร็จเมื่อวันที่ ๑๒ พฤษภาคม ๒๕๒๘
ในปี พ.ศ. ๒๕๓๓ สปช.ได้อนุมัติเงินจำนวน ๒๐๐,๐๐๐ บาท ต่อเติมใต้ถุนอาคารเรียน ขนาด ๓ ห้องเรียน
ในปี พ.ศ. ๒๕๔๑ ทางราชการได้อนุมัติงบประมาณ ๑๑๐,๐๐๐ บาท ให้สร้างส้วมอีก หนึ่งหลัง ขนาด ๔ ที่
ในปี พ.ศ. ๒๕๔๔ สปจ. ได้อนุมัติเงิน ๓๕,๐๐๐ บาท เพื่อซ่อมแซมอาคารเรียนโดยเปลี่ยนสังกะสีหลังคาทั้งหมด
ในปี พ.ศ. ๒๕๖๐ ได้ปรับปรุงสร้างโรงอาหารใหม่ ห้องคอมพิวเตอร์ เรือนเพาะชำ ที่แปรงฟัน โดยได้รับงบประมาณจากคณะผ้าป่าและผู้มีจิตศรัทธาร่วมกันบริจาค
ปีการศึกษา ๒๕๖๓ เปิดทำการสอนตั้งแต่ชั้น อนุบาล ๑ จนถึงชั้นประถมศึกษาปีที่ ๖ รวม ๘ ห้องเรียน มีนักเรียนทั้งสิ้น ๙๖ คน ครู ๘ คน ช่างครุภัณฑ์ ๑ คน
ปีการศึกษา ๒๕๕๖ เปิดทำการสอนตั้งแต่ชั้น อนุบาล ๑ จนถึงชั้นประถมศึกษาปีที่ ๖ รวม ๘ ห้องเรียน มีนักเรียนทั้งสิ้น ๙๓ คน ครู ๖ คน ช่างครุภัณฑ์ ๑ คน
ปีการศึกษา ๒๕๖๓ เปิดทำการสอนตั้งแต่ชั้น อนุบาล ๑ จนถึงชั้นประถมศึกษาปีที่ ๖ รวม ๘ ห้องเรียน มีนักเรียนทั้งสิ้น ๖๓ คน ครู ๖ คน ช่างครุภัณฑ์ ๑ คน