โรงเรียนบ้านแสลงโทน ตั้งขึ้นเมื่อวันที่ 1 มกราคม พ.ศ. 2468 โดยอาศัยศาลาวัดบ้านแสลงโทน เป็นสถานที่เล่าเรียนให้ชื่อว่า “โรงเรียนประชาบาลตำบลบ้านไทร 1
(บ้านแสลงโทน)”
ต่อมาเมื่อปี พ.ศ. 2476 แผนกศึกษาธิการอำเภอประโคนชัย ได้ซื้อห้องแถวชั้นเดียวจากนายปอชุน แซ่อึง ในราคา 300 บาท รวมทั้งที่ดิน แล้วย้ายที่เรียนจากวัดบ้านแสลงโทนมาเรียนที่อาคารแห่งนี้ ใช้ชื่อว่า “โรงเรียนประชาบาลตำบลบ้านไทร 1 (บ้านแสลงโทน)” ที่ดินแห่งนี้กว้าง 50 เมตร ยาว 77 เมตร ปัจจุบันอยู่หมู่ที่ 1 ตำบลแสลงโทน
เมื่อวันที่ 19 เมษายน พ.ศ. 2496 ได้รับงบประมาณจากกระทรวงศึกษาธิการ จำนวน 11,988 บาท ให้ปลูกสร้างอาคารเรียนใหม่ตามแบบ ป.1 ของกระทรวงศึกษาธิการ โดยทำการก่อสร้างในที่ดินแปลงใหม่ ซึ่งมีเนื้อที่ 56 ไร่ เนื่องจากงบประมาณมีน้อยจึงได้รื้ออาคารหลังเก่า เอาไม้และสังกะสีมาใช้ในการก่อสร้าง ได้เพียงปูพื้น มุงหลังคา ตีฝา และย้ายมาอยู่ที่ใหม่เมื่อวันที่ 15 กันยายน พ.ศ. 2496 ตั้งชื่อใหม่ว่า โรงเรียนบ้านแสลงโทน นับแต่นั้นมาโรงเรียนบ้านแสลงโทนพัฒนาตนเองมาโดยลำดับ ดังนี้
ปี พ.ศ. 2511
1. สร้างอาคารเรียนแบบ ป.1 ซ. 3 ห้องเรียน งบประมาณ 90,000 บาท
2. สร้างบ้านพักครู 1 หลัง งบประมาณ 20,000 บาท
3. สร้างโรงฝึกงาน 1 หลัง งบประมาณ 30,000 บาท
4. สร้างส้วมซึม 4 ที่ งบประมาณ 5,000 บาท (ได้รับอนุญาตรื้อถอนแล้ว)
5. สร้างอาคารเรียนแบบ ป.1 ค 2 ห้องเรียน งบประมาณ 40,000 บาท
ปี พ.ศ. 2514 สร้างบ้านพักครูแบบไทยยกพื้นตามแบบของกรมสามัญศึกษา 2 หลัง ราคา หลังละ 2,500 บาท งบประมาณ 5,000 บาท
ปี พ.ศ. 2515 คณะกรรมการการศึกษาสร้างเสาธงเหล็กมอบให้ งบประมาณ 3,000 บาท
ปี พ.ศ. 2517
1. สร้างอาคารเรียนแบบ ป.1 ซ. 3 ห้องเรียน งบประมาณ 90,000 บาท
2. สร้างถังน้ำฝน 6 ที่ งบประมาณ 17,000 บาท
ปี พ.ศ. 2519
1. ต่อเติมอาคารเรียนแบบ ป.1 ซ.1 ห้อง งบ กสช. 50,000 บาท
2. สร้างบ้านพักครูมีห้องน้ำพร้อม 1 หลัง งบประมาณ 50,000 บาท
3. สร้างอาคารเรียนแบบ ป.1 ซ. พื้นสูง 3 ห้อง งบประมาณ 150,000 บาท
ปี พ.ศ. 2521
1. สร้างส้วม 3 ที่ (ติดเขตโรงเรียนด้านทิศตะวันออก) งบประมาณ 10,000 บาท
2. สร้างส้วม 3 ที่ (ติดเขตโรงเรียนด้านทิศตะวันตก) งบประมาณ 10,000 บาท
ปี พ.ศ. 2525 ขยายเขตไฟฟ้าแรงสูง งบพัฒนาจังหวัด ส.ส.พิชิต ธีรรัชตานนท์ งบประมาณ 75,909 บาท
ปี พ.ศ. 2526
1. สร้างอาคารเรียนแบบ สปช. 105/26 จำนวน 8 ห้องเรียน งบประมาณ 1,000,000 บาท
2. เจาะบ่อบาดาลของกรมทรัพยากรธรณี งบประมาณ 80,000 บาท
3. สร้างอีฮีนเก็บน้ำฝน งบ 5,000 บาท
4. เจาะบ่อน้ำบาดาล งบ รพช. งบ 80,000 บาท
ปี พ.ศ. 2529
1. ส้วมซึม 8 ที่นั่ง
2. ถังประปาคอนกรีต (งบ ส.ส.พิชิต ธีรรัชตานนท์) งบประมาณ 20,000 บาท
ปี พ.ศ. 2530
1. หอประชุมแบบ สปช. 205/2526 งบประมาณ 820,000 บาท
2. บ้านพักนักการภารโรงแบบ สปช.304/2526 งบประมาณ 80,000 บาท
ปี พ.ศ. 2531
1. ส้วม 4 ที่นั่งแบบ สปช. 601/2526 งบประมาณ 40,000 บาท
2. ขยายเขตแรงต่ำ (ไฟฟ้าทุกห้องเรียน) งบ 98,000 บาท
ปี พ.ศ. 2532 สร้างสนามกีฬาแบบ ฝ.3 (งบพิเศษ) งบประมาณ 175,000 บาท
ปี พ.ศ. 2541 สร้างถนนคอนกรีตรอบบริเวณสนามโรงเรียน งบประมาณ 60,000 บาท
ปี พ.ศ. 2543
1. สร้างสนามกีฬาเอนกประสงค์ งบประมาณ 60,000 บาท
2. สร้างถังอีฮีนเก็บน้ำฝน 4 คอลัมน์ งบประมาณ 50,000 บาท
ปี 2559 สร้างอาคารเรียนแบบ สปช.104/26 ใต้ถุนโล่ง ขนาด 3 ห้องเรียน งบประมาณ 1985000
ปี 2560 สร้างอาคารอเนกประสงค์หลังคาทรงโดม ขนาด กว้าง 20 เมตร ยาว 40 เมตร งบประมาณ 1500000
ปัจจุบันโรงเรียนเปิดสอนตั้งแต่ชั้นอนุบาลถึงชั้นมัธยมศึกษาปีที่ 3 โดยใช้หลักสูตรแกนกลางการศึกษาขั้นพื้นฐาน พุทธศักราช 2542 ของกระทรวงศึกษาธิการและหลักสูตรโรงเรียนบ้านแสลงโทน พ.ศ. 2546