โรงเรียนบ้านคลองตะแบก  เดิมชื่อว่าโรงเรียนประชาบาลตำบลลาดบัวขาว  (วัดคลองตะแบก)  ก่อตั้งขึ้นเมื่อวันที่  1  เมษายน 2464  โดยหลวงสมุทรภูมิรักษา  นายอำเภอสีคิ้ว  เดิมอาศัยศาลาการเปรียญวัดคลองตะแบก  เปิดทำการสอนตั้งแต่ชั้นประถมศึกษาปีที่  1  - 4  เป็นมานานถึง  90  ปีกว่า 

ในปี  พ.ศ.  2508  ทางราชการอนุมัติงบประมาณและประชาชนร่วมกันบริจาคเงินสร้างอาคารแบบอาคาร  แบบ  ป.พิเศษ  5  ห้องเรียน  1  หลัง  บนที่ดินจากการจับจองของชาวบ้าน และจากการบริจาคมีจำนวน  2  แปลง คือ  บริเวณปากทางเข้าหมู่บ้านด้านทิศตะวันตก เนื้อที่ 14 ไร่ 81 ตารางวา และบริเวณที่ตั้งโรงเรียนปัจจุบัน เนื้อที่ 9  ไร่ 79 ตารางวา  ต่อมาเปลี่ยนชื่อเป็นโรงเรียนบ้านคลองตะแบก

     ในปี  พ.ศ.  2517  โรงเรียนได้รับอนุญาตให้เปิดทำการสอนถึงชั้นประถมศึกษาปีที่  7  และได้รับงบประมาณก่อสร้างอาคารเรียนแบบ ป.1 ฉ  ยังไม่ต่อเติมอีก 1 หลัง

     ในปี พ.ศ. 2533  โรงเรียนได้รับงบประมาณก่อสร้างอาคารเอนกประสงค์  แบบ สปช. 202/20  จำนวน  1  หลัง

     ตั้งแต่โรงเรียนย้ายจากศาลาการเปรียญวัดคลองตะแบกมาอยู่ในพื้นที่ปัจจุบัน  มีผู้บริหาร  ดังนี้ นายสว่าง  กิจจาไกร,  นายพวง  พลรักมิตร,  นายวิทยา  ท่วมสูงเนิน,  นายบุญส่ง  วัฒนาการ,  นางสังวาลย์  พงษ์บำรุงเนตร, นายเลิศ  ปิยพิทยากร, นายชัยมงคล  บุญช่วย,  นายยงยุทธ์  ภูเนาว์นิล , นายเชี่ยวชาญ  ท่าพิมาย,  นายธนิต  คัมภิรานนท์, นายสมคิด  พินิจ    และผู้อำนวยการโรงเรียนคนปัจจุบันคือ นางสาวช่อรัก พันธ์สวัสดิ์