โรงเรียนบ้านหัวหมอน ตั้งอยู่ที่ หมู่ที่ 3 ตำบลบึงศาล อำเภอองครักษ์ จังหวัดนครนายก เดิมต้องเดินไปเรียนที่โรงเรียนบ้านดอนกลาง(กิดารีศึกษาคาร) ซึ่งอยู่ห่าง ไปทางทิศใต้ประมาณ 2 กิโลเมตร การคมนาคมสมัยนั้นไม่สะดวกเพราะไม่มีถนน เด็กนักเรียนต้องใช้เรือเป็นพาหนะในการเดินทางไปโรงเรียน ต่อมานายเซ็ม อิบรอฮีมและชาวบ้านหัวหมอน ได้จัดทำคำร้องขอแยกโรงเรียนจากโรงเรียนบ้านดอนกลางมาสร้างโรงเรียนขึ้นใหม่โดยใช้อาคารมัสยิดเป็นอาคารเรียนชั่วคราว ต่อมาได้มีคำสั่งของอำเภอองครักษ์ที่ 1322/2501 ลงวันที่ 13 มิถุนายน 2501 ให้จัดสร้างโรงเรียนใหม่และได้เริ่มเปิดทำการสอนตั้งแต่วันที่ 10 มิถุนายน 2501 โดยมีนายเซ็ม อิบรอฮีม ได้บริจาคที่ดินฝั่งตรงข้ามมัสยิด ก้ามาลุ้ลอิบาดะห์ จำนวน 5 ไร่ ให้เป็นที่ก่อสร้างโรงเรียนในปัจจุบัน สภาพแวดล้อมของชุมชนโดยรอบโรงเรียนบ้านหัวหมอนเป็นชุมชนที่ประกอบอาชีพเกษตรกรรม และการรับจ้างเป็นหลัก ประชากรส่วนใหญ่มีฐานะค่อนข้างยากจนถึงปานกลาง
ปัจจุบันโรงเรียนบ้านหัวหมอน เปิดทำการสอน 2 ระดับ คือ
1) ระดับก่อนประถมศึกษา
2) ระดับประถมศึกษา
มีข้าราชการครู 6 คน ผู้บริหาร 1 คน บุคลากรคณิตศาสตร์ 1 คน เจ้าหน้าที่ธุรการ 1 คน นักการภารโรง 1 คน
ในปีการศึกษา 2566 มีนักเรียนทั้งสิ้น 107 คน
นางสาวกัญญาพัชร จุลสุวรรณ ดำรงตำแหน่งผู้อำนวยการโรงเรียน