โรงเรียนวัดขอนชะโงก ฯ มีพันธกิจที่ต้องดำเนินงานดังนี้

๑. พัฒนาหลักสูตรสถานศึกษาให้สอดคล้องกับสภาพปัญหา ความต้องการของผู้เรียนชุมชนและเป็นไปตาม พ.ร.บ. การศึกษาแห่งชาติ

๒.  จัดการศึกษาสำหรับเด็กวัยเรียนอย่างทั่วถึง และมีคุณภาพ สามารถนำความรู้ไปใช้ในชีวิตประจำวันและศึกษาต่อในระดับสูงได้

๓.  พัฒนาการเรียนการสอนทุกกลุ่มสาระการเรียนรู้ให้ได้มาตรฐานการศึกษาขั้นพื้นฐาน

๔.  ส่งเสริมสนับสนุนให้ชุมชนเข้ามามีส่วนร่วมในการจัดการศึกษา อนุรักษ์สิ่งแวดล้อม ทรัพยากรธรรมชาติ และภูมิปัญญาท้องถิ่น

๕.  พัฒนาสภาพภูมิทัศน์ภายในโรงเรียน ให้สะอาด ร่มรื่น สดชื่น สวยงาม และปลอดภัย

๖.  พัฒนาสื่อ เทคโนโลยีสารสนเทศ และนวัตกรรม ให้เกิดประสิทธิภาพต่อการบริหารและการจัดการเรียนการสอน

๗.  พัฒนาระบบนิเทศ กำกับ ติดตาม ประเมินผล และรายงานผลให้มีคุณภาพ

๘.  พัฒนาศักยภาพครูและบุคลากรทางการศึกษาในทุก ๆ ด้าน