โรงเรียนบ้านพุบอนบน ชาวบ้านพุบอนบนเป็นผู้ก่อตั้ง เมื่อ เดือน กุมภาพันธ์ พ.ศ. 2521
โดยสร้างอาคารเรียนชั่วคราว โครงไม้ไผ่ หลังคามุงแฝก ขนาด 2 ห้องเรียน คิดเป็นเงิน 1,740 บาท
สร้างบนที่ดินของนายใจ จุลคีรี ซึ่งมอบที่ดินให้เป็นสมบัติของโรงเรียน  มีเนื้อที่ประมาณ 20 ไร่

          โรงเรียนบ้านพุบอนบน เปิดทำการสอนครั้งแรกเมื่อวันที่ 23 พฤษภาคม พ.ศ. 2521
โดยเปิดสอนเฉพาะ ชั้นประถมศึกษาปีที่ 1 เท่านั้น 

          ต่อมาเดือน พฤษภาคม พ.ศ. 2522 หน่วยเฉพาะกิจ กองพลที่ 1 รักษาพระองค์ฯ
ได้สร้างอาคารเรียนถาวรแบบ ป1ก. จำนวน 3 ห้องเรียนงบประมาณ 200,000 บาท
เสร็จเมื่อวันที่ 10 สิงหาคม พ.ศ. 2522 จึงให้ชื่อโรงเรียนนี้ว่า โรงเรียนบ้านพุบอนบน(ฉก.พล.รอ.)

          พลโทเทพ  กรานเลิศ แม่ทัพภาคที่ 1 และผู้อำนวยการป้องกันการกระทำอันเป็นคอมมิวนิสต์ภาคที่ 1
ร่วมด้วย ผู้ว่าราชการจังหวัดราชบุรี ผู้บังคับหน่วยเฉพาะกิจกองพลที่ 1 รักษาพระองค์ฯ
ได้มากระทำการส่งมอบโรงเรียน ให้กับจังหวัดราชบุรี เมื่อวันที่ 4 กันยายน พ.ศ. 2522
โรงเรียนนี้จึงเป็นสัญลักษณ์แห่งความร่วมมือของทุกฝ่าย โดยเฉพาะชาวบ้านพุบอนบน กับทหารของ ฉก.พล1

         เมื่อวันที่ 10 กรกฎาคม พ.ศ. 2522 นิสิตโครงการอาสาพัฒนา คณะครุศาสตร์ จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย
จำนวน 35 คน ได้มาจัดหา สร้างสื่อ วัสดุอุกรณ์การศึกษา เช่นกระดานดำ ป้ายนิเทศ ป้ายสถิติ และปลูกไม้ดอก
ไม้ประดับตลอดจนไม้ยืนต้นเพื่อเป็นร่มเงาให้แก่โรงเรียน

          ปัจจุบันปีการศึกษา  2549 โรงเรียนบ้านพุบอนบน สังกัดสำนักงานเขตพื้นที่การศึกษา ราชบุรีเขต 1
สำนักงานคณะกรรมการการศึกษาขั้นพื้นฐาน กระทรวงศึกษาธิการ
เปิดทำการสอนตั้งแต่ชั้นอนุบาล 1 จนถึงชั้นประถมศึกษา ปีที่ 6
มีข้าราชการครู 5 คน นักเรียน 75 คน เป็นชาย 37 คนและหญิง 38 คน  และนักการภารโรง 1 คน
นายสุพัต อ่อนน้อม ดำรงตำแหน่งผู้อำนวยการสถานศึกษา โรงเรียนบ้านพุบอนบน
นายสุรศักดิ์ สอดศรี ผู้ใหญ่บ้านหมู่ที่ 5 ตำบลบ้านบึง เป็นประธานคณะกรรมการการศึกษาขั้นพื้นฐาน
โรงเรียนบ้านพุบอนบน